More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1898 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 331 aa  666    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  67.07 
 
 		 331 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  52.74 
 
 		 337 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  50.91 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  49.09 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  49.7 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  50.3 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  48.77 
 
 		 328 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  51.8 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  43.94 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  41.54 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  40.44 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  39.25 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  38.01 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  37.87 
 
 		 355 aa  212  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  38.28 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  37.21 
 
 		 353 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  37.72 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  37.28 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  43.78 
 
 		 432 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 439 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  35.61 
 
 		 353 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  36.01 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 431 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 436 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  37.09 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 436 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 431 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 431 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 431 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  35.59 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 436 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  34.44 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 431 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  33.93 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  33.82 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 		 431 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  37.13 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 		 431 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 438 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 		 431 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  34.21 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  32.55 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  34.81 
 
 		 432 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  39.05 
 
 		 429 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 359 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 		 431 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  33.82 
 
 		 436 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  32.25 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  34.59 
 
 		 440 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  34.43 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 440 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  31.95 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  31.33 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 439 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  31.91 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 441 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  31.31 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  31.76 
 
 		 347 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  31.76 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  31.76 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  33.92 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  34.21 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  35.98 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  31.76 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  34.13 
 
 		 439 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  35.42 
 
 		 439 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  33.92 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  31.58 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  33.92 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  37.63 
 
 		 441 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  35.06 
 
 		 430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  31.76 
 
 		 347 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>