More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1792 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
410 aa  814    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  43.87 
 
 
427 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  41.57 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  41.71 
 
 
430 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  41.49 
 
 
418 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  43.84 
 
 
437 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  43.69 
 
 
435 aa  296  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  40.74 
 
 
440 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  40.52 
 
 
436 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  41.26 
 
 
435 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  39.86 
 
 
439 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  39.1 
 
 
448 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  37.97 
 
 
432 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 
436 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  44.35 
 
 
432 aa  285  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  39.11 
 
 
436 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  44.9 
 
 
448 aa  283  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  41.01 
 
 
445 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 
433 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 
463 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  44.38 
 
 
437 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  39.16 
 
 
432 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  40.43 
 
 
437 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  40.43 
 
 
437 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
447 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2623  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 
438 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 
444 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 
431 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 
434 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 
434 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  41.16 
 
 
436 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  38.41 
 
 
436 aa  279  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 
443 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  36.15 
 
 
427 aa  279  7e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 
443 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 
431 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 
434 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 
436 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 
431 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 
432 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  43.24 
 
 
455 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  44.89 
 
 
440 aa  278  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 
442 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  37.56 
 
 
431 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  37 
 
 
431 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 
438 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 
436 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  37.09 
 
 
431 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  46.08 
 
 
428 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  41.81 
 
 
432 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 
431 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  37.21 
 
 
431 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 
430 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  37.21 
 
 
431 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.34 
 
 
431 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 
440 aa  276  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 
431 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 
438 aa  276  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1252  Homoserine dehydrogenase  42.93 
 
 
450 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 
428 aa  275  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2356  homoserine dehydrogenase  41.8 
 
 
442 aa  275  8e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 
431 aa  275  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 
443 aa  275  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 
431 aa  275  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 
431 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 
442 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 
442 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 
431 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 
449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 
436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  43.95 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 
434 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  42.05 
 
 
431 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  39.16 
 
 
434 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 
436 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 
437 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  41.15 
 
 
440 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  38.94 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  38.66 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  42.52 
 
 
428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 
441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38.83 
 
 
431 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  36.77 
 
 
436 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  39.63 
 
 
441 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  42.42 
 
 
427 aa  272  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 
436 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  36.81 
 
 
434 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  39.47 
 
 
436 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  42.66 
 
 
439 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  39.25 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>