More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0696 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  686    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  42.04 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  38.87 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 328 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 		 331 aa  225  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  37.57 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  36.61 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  36.9 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  34.68 
 
 		 353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  33.82 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  33.82 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  37.04 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  35.38 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  37.04 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  34.01 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  32.66 
 
 		 353 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  34.45 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  31.87 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  32.85 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  32.85 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  32.85 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  32.85 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  34.44 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  32.64 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  34.55 
 
 		 317 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  34.74 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 418 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  32.06 
 
 		 341 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  34.45 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  32.44 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  34.3 
 
 		 431 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  33.03 
 
 		 429 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  32.55 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  32.54 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  32.36 
 
 		 436 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.01 
 
 		 431 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  33.72 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  32.36 
 
 		 418 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  32.07 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  34.81 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  32.53 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  30.84 
 
 		 427 aa  159  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 431 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  32.17 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  30.5 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  37.84 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  32.84 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 431 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  31.85 
 
 		 441 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  38.37 
 
 		 432 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  35.11 
 
 		 440 aa  156  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 436 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  31.25 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  34.01 
 
 		 439 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  32.45 
 
 		 436 aa  155  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  39.13 
 
 		 435 aa  155  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  32.45 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  32.06 
 
 		 440 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  31.55 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  31.25 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  30.54 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  32.25 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>