More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1004 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  666    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  81.85 
 
 
337 aa  549  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  81.01 
 
 
337 aa  541  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  80.65 
 
 
337 aa  541  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  70.66 
 
 
340 aa  477  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  52.74 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  51.98 
 
 
331 aa  323  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  47.92 
 
 
335 aa  276  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 
328 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  41.79 
 
 
328 aa  266  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  40.6 
 
 
330 aa  255  9e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
353 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  38.78 
 
 
355 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 
328 aa  236  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 
353 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 
347 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  39.36 
 
 
436 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 
349 aa  212  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
347 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  36.69 
 
 
336 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 
317 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  38.78 
 
 
436 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 
315 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  35.38 
 
 
346 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  40.48 
 
 
427 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  37.01 
 
 
436 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  34.81 
 
 
341 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  38.62 
 
 
441 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  45.19 
 
 
429 aa  198  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  45.99 
 
 
432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 
436 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 
431 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 
341 aa  195  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  35.76 
 
 
319 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 
436 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 
347 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 
341 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  34.81 
 
 
347 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 
436 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 
435 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  35.45 
 
 
353 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 
347 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 
347 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 
347 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  34.11 
 
 
328 aa  192  7e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 
432 aa  192  9e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  36.55 
 
 
428 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  34.87 
 
 
353 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 
319 aa  189  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
441 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  37.83 
 
 
440 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 
441 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  35.88 
 
 
438 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 
432 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  43.41 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  33.05 
 
 
359 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 
430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 
438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 
440 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  34.91 
 
 
449 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 
418 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  35.19 
 
 
439 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  33.62 
 
 
374 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 
439 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  38.42 
 
 
427 aa  182  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  34.9 
 
 
436 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 
439 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  37.13 
 
 
438 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  36.95 
 
 
418 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 
431 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 
424 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 
431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  39.69 
 
 
431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  34.81 
 
 
452 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  33.73 
 
 
447 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
431 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 
417 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 
431 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
431 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
431 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 
417 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 
431 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 
431 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
431 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 
431 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 
436 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
431 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
431 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
431 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
431 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 
431 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 
438 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  34.72 
 
 
436 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>