More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1971 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  696    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  88.07 
 
 		 353 aa  604  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  52.84 
 
 		 350 aa  319  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.68 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  35.16 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  39.03 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  31.99 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  32.47 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  32.47 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  31.61 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  31.61 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  31.61 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  31.32 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  31.03 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  31.14 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  37.75 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  31.32 
 
 		 341 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  30.77 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  36.18 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  36.49 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  37.93 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  33.52 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  38.5 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  37.22 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  34.08 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  30.46 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  32.1 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  32.1 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  31.62 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  34.29 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  32.39 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  32.39 
 
 		 436 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  31.82 
 
 		 439 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  32.1 
 
 		 439 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  33.52 
 
 		 436 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  32.86 
 
 		 440 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  33.62 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  30.09 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  36.33 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 		 439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  35.26 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  35.92 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  31.23 
 
 		 431 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  31.53 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 		 432 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  34.54 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 431 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.74 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  38.66 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  31.23 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  31.07 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  29.31 
 
 		 428 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2495  homoserine dehydrogenase  33.74 
 
 		 439 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.35731  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.25 
 
 		 431 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 449 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  35.83 
 
 		 431 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  30.48 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  34.26 
 
 		 440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  33.87 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  32.01 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  33.64 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  28.05 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 432 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  32.72 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  32.68 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  31.82 
 
 		 436 aa  126  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 		 455 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>