More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0155 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  627  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  71.34 
 
 		 317 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  72.56 
 
 		 315 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  67.78 
 
 		 319 aa  427  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  70.34 
 
 		 319 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  44.88 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  42.77 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  44.28 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  44.44 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  42.3 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  40.72 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  35.76 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  35.47 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  34.59 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  34.49 
 
 		 337 aa  195  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  35.97 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  39.58 
 
 		 436 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 429 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  36.44 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  35.63 
 
 		 441 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  35.63 
 
 		 441 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 		 431 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 		 431 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  34.85 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 431 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  36.23 
 
 		 439 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  38.24 
 
 		 436 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 431 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 431 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  34.33 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  34.33 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 		 440 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  33.73 
 
 		 431 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  39.04 
 
 		 438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  31.47 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  31.25 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  37.36 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  34.14 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  35.44 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  40.15 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 439 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  30.15 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 420 aa  143  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  38.37 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  33.21 
 
 		 431 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  37.4 
 
 		 739 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  32.64 
 
 		 431 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  31.64 
 
 		 720 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  36.12 
 
 		 438 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  36.13 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  31.7 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  36 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.93 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  34.96 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 429 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  37.3 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  38.52 
 
 		 440 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  38.52 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  29.04 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  33.23 
 
 		 431 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 438 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 430 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 		 437 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  32.84 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  37.59 
 
 		 439 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  32.24 
 
 		 436 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  38.97 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  37.1 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  37.1 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  34.42 
 
 		 436 aa  136  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  31.85 
 
 		 428 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 437 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 444 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  31.56 
 
 		 422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  37.59 
 
 		 424 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  35.97 
 
 		 440 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  34.38 
 
 		 347 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3015  Homoserine dehydrogenase  29.17 
 
 		 398 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00421083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  32.63 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  33.52 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  32.63 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  32.63 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  32.93 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  32.63 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  31.75 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>