More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1993 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  653    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  68.6 
 
 		 328 aa  456  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  67.18 
 
 		 328 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  63.11 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  59.88 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  49.85 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  48.77 
 
 		 331 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  42.99 
 
 		 337 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  44.63 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  42.39 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  46.75 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  46.15 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  45.06 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  46.54 
 
 		 319 aa  249  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  44.58 
 
 		 328 aa  238  6.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  42.73 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  39.52 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  38.79 
 
 		 359 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  38.79 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  38.22 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  40.13 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 		 347 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  36.61 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 431 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 431 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  38.28 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  38.69 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  37.01 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 		 426 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 436 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 431 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 431 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 		 440 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  38.07 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  39.14 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  34.21 
 
 		 439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  36.86 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  36.86 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  39.14 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  41.49 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  36.56 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  37.17 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  35.89 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  40.43 
 
 		 440 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  36.83 
 
 		 439 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 		 428 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 		 439 aa  185  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 427 aa  185  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  35.95 
 
 		 441 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  37.84 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 418 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  36.83 
 
 		 439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 		 430 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  38.24 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  35.56 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  43.35 
 
 		 438 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  36.44 
 
 		 428 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 445 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 436 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 445 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 445 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  37.42 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 		 448 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  35.57 
 
 		 456 aa  179  4.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  38.74 
 
 		 440 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  44.07 
 
 		 440 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  37.91 
 
 		 428 aa  179  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  34.43 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  39.13 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  35.98 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  37.27 
 
 		 436 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  34.62 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>