More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0664 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 347 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  98.27 
 
 		 347 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  69.01 
 
 		 353 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  60.12 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  49.29 
 
 		 359 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  48.87 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  48.72 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  45.45 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  44.41 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  37.87 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  37.28 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  37.28 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  38.28 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 330 aa  203  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  39.07 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  39.35 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  38.66 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.57 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 417 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 417 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 431 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  35.28 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  42.16 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  36.84 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  37.98 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  35.06 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  33.82 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  36.9 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  33.62 
 
 		 436 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 431 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 		 436 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 431 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 		 431 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 431 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 431 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 431 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 439 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 436 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 431 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 		 431 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14810  homoserine dehydrogenase  36.1 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.342175  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  34.21 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  35.21 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 347 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  31.38 
 
 		 347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 431 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  42.31 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  30.77 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  40.43 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  39.23 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0299  Homoserine dehydrogenase  39.62 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  32.15 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  30.77 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 436 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 440 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  36.83 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  32.26 
 
 		 438 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  30.77 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  38.43 
 
 		 428 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48694  predicted protein  39.06 
 
 		 437 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203974  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  34.29 
 
 		 455 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  34.71 
 
 		 427 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  32.95 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  40.85 
 
 		 429 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  35.86 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  40.43 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>