More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48694 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48694  predicted protein  100 
 
 		 437 aa  890    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203974  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26813  predicted protein  46.82 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 431 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  39.95 
 
 		 431 aa  279  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  39.48 
 
 		 431 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  39.48 
 
 		 431 aa  276  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  39.48 
 
 		 431 aa  276  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  39.48 
 
 		 431 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  39.48 
 
 		 431 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  39.53 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  41.77 
 
 		 438 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  40.34 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  42.71 
 
 		 435 aa  259  7e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  41.88 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  40.1 
 
 		 438 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  37.26 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  37.79 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  40.05 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  39.59 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  37.97 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  36.3 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  37.33 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  40.53 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  39.05 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  35.67 
 
 		 440 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  37.1 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  36.64 
 
 		 443 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  35.94 
 
 		 436 aa  250  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  37.41 
 
 		 431 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  37.53 
 
 		 436 aa  249  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 		 435 aa  249  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.56 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  37.09 
 
 		 442 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 		 448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  37.81 
 
 		 449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 431 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  37.09 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  37.09 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  38.26 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  37 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  37.12 
 
 		 436 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  36.82 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 		 442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  36.62 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3206  homoserine dehydrogenase  38.48 
 
 		 453 aa  242  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  37.66 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  38.68 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  36.41 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2559  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  40.46 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  38.68 
 
 		 439 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  36.16 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  37.44 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  36.43 
 
 		 438 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 		 418 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  37.4 
 
 		 431 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  34.64 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  35.68 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  38.53 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  35 
 
 		 439 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  37.1 
 
 		 436 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  36.57 
 
 		 423 aa  237  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  38.27 
 
 		 441 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  37.41 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  35.56 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  35.56 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  37.86 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  36.75 
 
 		 439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  39.29 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  37.03 
 
 		 434 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  35.28 
 
 		 452 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  37.03 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  39.29 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  39.04 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  35.05 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  33.83 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  39.24 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  42.34 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 410 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  38.96 
 
 		 441 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  35.64 
 
 		 434 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  35.53 
 
 		 437 aa  229  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  35.41 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>