More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0299 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0299  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 360 aa  712    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 428 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  41.89 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  40.35 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 431 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 431 aa  219  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  37.25 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 433 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  39.88 
 
 		 445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  37.25 
 
 		 431 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  42.43 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  42.46 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  38.15 
 
 		 440 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  40.53 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  37.64 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  41.84 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  35.62 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  35.07 
 
 		 433 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  40.53 
 
 		 434 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 432 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  39.05 
 
 		 434 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  39.48 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 424 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  39.78 
 
 		 436 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 		 432 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  38.6 
 
 		 432 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  38.86 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  41 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  38.69 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 		 434 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  39.23 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  38.76 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  35.75 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  37.86 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 438 aa  205  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  38.76 
 
 		 434 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  37.36 
 
 		 436 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  37.43 
 
 		 739 aa  203  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  36.75 
 
 		 720 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 433 aa  203  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  40.3 
 
 		 436 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 434 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 434 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  37.9 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  38.17 
 
 		 434 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  37.07 
 
 		 436 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  36.18 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  41.78 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  40.95 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  38 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  39.35 
 
 		 429 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 		 430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  39.12 
 
 		 432 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  39.88 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  40.36 
 
 		 429 aa  199  9e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  40.95 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  37.98 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  36.99 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  37.17 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0975  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000487265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  38.64 
 
 		 440 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1209  homoserine dehydrogenase  41.14 
 
 		 450 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0141244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  40.23 
 
 		 439 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 		 417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  35.12 
 
 		 418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 		 429 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 437 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  37.94 
 
 		 437 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  38.35 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  38.36 
 
 		 469 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>