More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1481 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 431 aa  881    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  37.83 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  39.48 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  34.74 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  37.77 
 
 		 440 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  37.26 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 		 441 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  36.86 
 
 		 449 aa  262  8.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  36.48 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  36.48 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 431 aa  260  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  36.87 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  35.15 
 
 		 436 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  34.38 
 
 		 428 aa  259  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  34.79 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  36.12 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  34.28 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  35.07 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  34.62 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 442 aa  256  7e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  35.25 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  35.87 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  37.17 
 
 		 431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  37.17 
 
 		 431 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.91 
 
 		 431 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0019  homoserine dehydrogenase  40.5 
 
 		 435 aa  252  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  38.11 
 
 		 440 aa  252  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.91 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  38.68 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  36.65 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.46 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  36.43 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 436 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 431 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 431 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  35.78 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  35.87 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  37.32 
 
 		 436 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  37.18 
 
 		 439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  35.14 
 
 		 418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 		 431 aa  245  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  37.37 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  36.81 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  36.38 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  35.15 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  34.94 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  34.64 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  37.11 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  34.88 
 
 		 447 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  34.73 
 
 		 438 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  35.56 
 
 		 410 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  37.21 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  34.74 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 463 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  35.44 
 
 		 436 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  34.75 
 
 		 437 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  34.29 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  34.29 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 424 aa  239  6.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  35.86 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  35.22 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  34.36 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  36.99 
 
 		 448 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0145  homoserine dehydrogenase  35.34 
 
 		 415 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  35.15 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  38.26 
 
 		 431 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  36.43 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  36.43 
 
 		 442 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1541  homoserine dehydrogenase  38.54 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  36.43 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0293  homoserine dehydrogenase  36.89 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  37.07 
 
 		 427 aa  237  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 433 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  35.41 
 
 		 445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  38.18 
 
 		 438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  33.98 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  35.57 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0164  homoserine dehydrogenase  35.07 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  35.17 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>