More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4165 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 340 aa  699    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  38.74 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 355 aa  205  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  36.15 
 
 		 359 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  35.86 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  34.76 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 347 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  32.43 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  31.17 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  30.24 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  30.54 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  31.2 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  30.59 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  32.09 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  31.8 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  31.89 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  30.72 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  31.07 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  29.48 
 
 		 441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  29.88 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  29.26 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  30.46 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  30.28 
 
 		 433 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  29.25 
 
 		 428 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  30.77 
 
 		 441 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  32.59 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  28.66 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  30.15 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  30.27 
 
 		 431 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  28.71 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  28.71 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  30.46 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  28.71 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  35.22 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  29.09 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  30.32 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  28.39 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  31.82 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  30.4 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  30.06 
 
 		 720 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  33.76 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  31.23 
 
 		 739 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  28.23 
 
 		 431 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  32.76 
 
 		 436 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01680  homoserine dehydrogenase  30.07 
 
 		 429 aa  129  8.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  hitchhiker  0.0000000000000909151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  29.18 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  29.18 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  31.34 
 
 		 448 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  28.92 
 
 		 435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  29.39 
 
 		 432 aa  128  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 439 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  27.44 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  27.76 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  30.94 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  32.19 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  28.74 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  31.12 
 
 		 434 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  27.44 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  31.46 
 
 		 431 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 		 431 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 		 431 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  30.16 
 
 		 432 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  31.67 
 
 		 430 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  31.65 
 
 		 418 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  31.1 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  28.98 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  27.68 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  34.06 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  29.66 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  34.32 
 
 		 445 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  33.76 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  27.01 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  38.42 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  38.34 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  26.69 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 438 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  37.82 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  29.25 
 
 		 436 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  29.13 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  28.93 
 
 		 441 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  31.15 
 
 		 441 aa  122  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  33.62 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  31 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  27.16 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>