More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2526 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  691    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  81.52 
 
 
347 aa  564  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  81.23 
 
 
347 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  81.52 
 
 
347 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  80.65 
 
 
347 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  81.23 
 
 
347 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  79.77 
 
 
346 aa  554  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  80.06 
 
 
346 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  80.94 
 
 
341 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  80.65 
 
 
341 aa  554  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  37.13 
 
 
342 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 
337 aa  193  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 
337 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 
340 aa  189  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 
337 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  31.38 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  32.64 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
336 aa  183  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  31.9 
 
 
353 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 
331 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  30.06 
 
 
353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  30.68 
 
 
350 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  31.32 
 
 
353 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  31.58 
 
 
331 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 
314 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  29.33 
 
 
349 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  30.86 
 
 
328 aa  159  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  34.25 
 
 
353 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  30.32 
 
 
330 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  30.18 
 
 
328 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  36.19 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  28.61 
 
 
429 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  30.14 
 
 
347 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  34.38 
 
 
335 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  30.09 
 
 
359 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  30.11 
 
 
374 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  30.14 
 
 
347 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  29.76 
 
 
317 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  29.83 
 
 
359 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  30.59 
 
 
432 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 
328 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  30.12 
 
 
431 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  29.26 
 
 
340 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  31.16 
 
 
431 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  30 
 
 
436 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  30.27 
 
 
431 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  29.5 
 
 
436 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  30.27 
 
 
431 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  30.27 
 
 
431 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  30.27 
 
 
431 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  30.27 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  29.5 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  32.91 
 
 
431 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  28.65 
 
 
431 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  30.21 
 
 
431 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  31.18 
 
 
439 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  30.86 
 
 
431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  29.24 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  27.51 
 
 
440 aa  139  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  33.9 
 
 
431 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  30.33 
 
 
441 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  28.83 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  33.05 
 
 
436 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  33.76 
 
 
424 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  28.65 
 
 
441 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1361  Homoserine dehydrogenase  29.11 
 
 
339 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.294507  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  29.59 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  29.79 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  29.38 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  29.12 
 
 
427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  29.72 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  32.76 
 
 
431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  27.62 
 
 
436 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  27.19 
 
 
439 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  27.49 
 
 
439 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1386  Homoserine dehydrogenase  34.84 
 
 
342 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000335812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  29.72 
 
 
435 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  29.48 
 
 
440 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  27.49 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  29.84 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  27.22 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  27.7 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  28.15 
 
 
439 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  28.49 
 
 
426 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  28.49 
 
 
426 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  27.51 
 
 
431 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  28.11 
 
 
433 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  28.66 
 
 
427 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  27.22 
 
 
417 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  28.28 
 
 
428 aa  129  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  27.22 
 
 
417 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3521  homoserine dehydrogenase  29.03 
 
 
428 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.843712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  27.22 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  27 
 
 
435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  27.22 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  27.22 
 
 
431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  27.22 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  34.35 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  29.2 
 
 
430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>