More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4072 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  97.14 
 
 		 350 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  96.57 
 
 		 350 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 350 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  46.09 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  40.48 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  42.49 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  42.18 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  40.35 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  41.38 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  38.87 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  34.19 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  33.9 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  36.8 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  32.36 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  32.66 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  35.91 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  37.43 
 
 		 353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  34.9 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  36.94 
 
 		 353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  31.58 
 
 		 314 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  32.66 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  39.43 
 
 		 441 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 440 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1386  Homoserine dehydrogenase  32.86 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000335812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  35.98 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  38.87 
 
 		 441 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  38.87 
 
 		 441 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  36.02 
 
 		 350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  29.43 
 
 		 427 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  33.46 
 
 		 441 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  27.27 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  27.27 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  36.39 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  26.98 
 
 		 347 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  31.43 
 
 		 431 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  32.66 
 
 		 439 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  26.69 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  30.88 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  31.68 
 
 		 440 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  34.11 
 
 		 440 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 319 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  26.98 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  34.39 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  32.33 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  32.37 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  26.98 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  34.39 
 
 		 440 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  34.87 
 
 		 441 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  36.69 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  34.87 
 
 		 441 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0860  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 438 aa  122  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.017488  hitchhiker  0.0000000731878 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  37.23 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  32.82 
 
 		 428 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  32.27 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  34.98 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  29.86 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  27.99 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  32.56 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  27.78 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  27.07 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  34.77 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  27.19 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  31.99 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  35.45 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0731  homoserine dehydrogenase  31.59 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  35.14 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  34.59 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  28.9 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  32.78 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  33.75 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 439 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2966  homoserine dehydrogenase  35.99 
 
 		 440 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0879  homoserine dehydrogenase  37.93 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.150193  normal  0.561705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 		 438 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  32.04 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0164  homoserine dehydrogenase  31.44 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  29.86 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  28.57 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  32.7 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  32.33 
 
 		 431 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  33.05 
 
 		 436 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  38.72 
 
 		 448 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2783  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 441 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  32.49 
 
 		 436 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  34.87 
 
 		 431 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 431 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>