More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0731 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0731  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 340 aa  671    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  35.45 
 
 		 317 aa  182  7e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  33.84 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  32.12 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  31.93 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0949  homoserine dehydrogenase  33.03 
 
 		 307 aa  143  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.949052 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0379  homoserine dehydrogenase  33.13 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.768095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  31.98 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  32.12 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0271  homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.508007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  30.72 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  30.72 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  31.25 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  32.25 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1842  homoserine dehydrogenase  31.6 
 
 		 303 aa  123  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  30.42 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  31.88 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  31.72 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  31.32 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  31.34 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  31.99 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  31.88 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  28.92 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  29.41 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  29.2 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  30.12 
 
 		 441 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  30.42 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  31.59 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  28.36 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  30.46 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  29.67 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  28.02 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  30.03 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  33.63 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  30.88 
 
 		 431 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  28.92 
 
 		 440 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0844  Homoserine dehydrogenase  28.21 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  31.74 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  28.44 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  28.44 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  27.14 
 
 		 440 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  27.14 
 
 		 436 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  31.74 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  30.79 
 
 		 439 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  32.74 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  27.63 
 
 		 440 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  32.17 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  32.16 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  28.31 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  28.18 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  29.25 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  28.7 
 
 		 435 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2035  Homoserine dehydrogenase  29.25 
 
 		 452 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  28.49 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  28.32 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  33.64 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  28.27 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  32 
 
 		 428 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  32 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  32.44 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  32.43 
 
 		 443 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  27.41 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  30.77 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  25.98 
 
 		 817 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  31.8 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  28.92 
 
 		 427 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  28.74 
 
 		 420 aa  100  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  31.14 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  29.08 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  29.33 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  31.8 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  26.44 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16870  predicted protein  28.13 
 
 		 810 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.254094  normal  0.0243125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  31.56 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  31.12 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  26.86 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  31.8 
 
 		 431 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  31.8 
 
 		 431 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  31.65 
 
 		 443 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  27.3 
 
 		 439 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  30.57 
 
 		 436 aa  99.4  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  27.83 
 
 		 436 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  31.34 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  31.34 
 
 		 431 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  32 
 
 		 433 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  31.34 
 
 		 431 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  25 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  31.34 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  30 
 
 		 448 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  31.34 
 
 		 431 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>