More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1842 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1842  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 303 aa  595  1e-169  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0271  homoserine dehydrogenase  78.07 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.508007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0949  homoserine dehydrogenase  63.25 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.949052 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0379  homoserine dehydrogenase  62.09 
 
 		 308 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.768095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.74 
 
 		 336 aa  142  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  34.8 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  32.42 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  32.54 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  30.09 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  32.81 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  34.52 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  34.16 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  32.54 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  34.85 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  31.35 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  32.72 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  30.79 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  31.74 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0731  homoserine dehydrogenase  31.29 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 347 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  30.96 
 
 		 331 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  30.63 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  30 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  30.06 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  29.01 
 
 		 436 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 		 432 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  33.48 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  29.1 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  36.24 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  28.71 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  33.77 
 
 		 428 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  32.56 
 
 		 431 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  35.22 
 
 		 739 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 417 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 417 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 431 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  35.22 
 
 		 720 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 438 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 431 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  33.46 
 
 		 428 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  32.9 
 
 		 436 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  31.23 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0299  Homoserine dehydrogenase  35.14 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  34.98 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  36.8 
 
 		 430 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  27.95 
 
 		 438 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  28.57 
 
 		 436 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 		 436 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  32.31 
 
 		 431 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  33.77 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  29.86 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  31.58 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  31.25 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 		 431 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  34.19 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1481  homoserine dehydrogenase  31.71 
 
 		 431 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  27.84 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  32.69 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  32.81 
 
 		 428 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  29.19 
 
 		 436 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 		 431 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 444 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 440 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  32.58 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  32.81 
 
 		 428 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1147  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 442 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0258107  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1385  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 442 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2396  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 442 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0022  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 442 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1875  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 442 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2232  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 442 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2270  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 442 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.606772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  30.82 
 
 		 440 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  35.53 
 
 		 443 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  28.35 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  34.65 
 
 		 436 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  34.78 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2198  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 		 442 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000198219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 449 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>