More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0498 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
317 aa  612  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  72.96 
 
 
319 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  71.97 
 
 
315 aa  432  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  71.34 
 
 
328 aa  426  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  70.48 
 
 
319 aa  423  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  46.15 
 
 
328 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  46.71 
 
 
328 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  44.51 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  46.23 
 
 
328 aa  241  9e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  42.28 
 
 
331 aa  231  9e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 
330 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  39.25 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  37.01 
 
 
340 aa  220  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 
337 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 
337 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 
337 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  40.48 
 
 
335 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.55 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  36.9 
 
 
353 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  38.25 
 
 
355 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  37.85 
 
 
436 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  40.32 
 
 
436 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 
436 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 
347 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  40.08 
 
 
431 aa  155  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  35.58 
 
 
436 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  35.67 
 
 
431 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  35.2 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  34.7 
 
 
436 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  39.34 
 
 
353 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 
432 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  36.62 
 
 
439 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  38.49 
 
 
739 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
349 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  37.09 
 
 
347 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  37.12 
 
 
439 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 
438 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  33.94 
 
 
336 aa  149  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  33.13 
 
 
439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  36.51 
 
 
428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 
436 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  36.31 
 
 
439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  39.75 
 
 
429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  37.38 
 
 
437 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  32.6 
 
 
431 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  37.07 
 
 
410 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  34.16 
 
 
431 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  34.16 
 
 
431 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  33.75 
 
 
428 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 
431 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  33.69 
 
 
431 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  33.75 
 
 
428 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  34.17 
 
 
417 aa  144  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  35.17 
 
 
441 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  39.84 
 
 
440 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  36.92 
 
 
720 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
431 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
417 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
431 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
431 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
417 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  40.16 
 
 
432 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  32.6 
 
 
431 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  32.6 
 
 
431 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  32.6 
 
 
431 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
431 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  41.85 
 
 
438 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  32.6 
 
 
431 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
431 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  32.6 
 
 
431 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  32.6 
 
 
431 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  33.65 
 
 
431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  34.56 
 
 
441 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  37.44 
 
 
427 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
431 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  42.29 
 
 
440 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  36.34 
 
 
435 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  32.21 
 
 
427 aa  139  6e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  42.44 
 
 
438 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  35.63 
 
 
441 aa  139  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  34.36 
 
 
440 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  34.98 
 
 
439 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  38.46 
 
 
431 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  36 
 
 
433 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  37.55 
 
 
431 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  35.88 
 
 
430 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  37.7 
 
 
429 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  39.66 
 
 
440 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  37.81 
 
 
448 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  39.66 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  33.76 
 
 
435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 
437 aa  136  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  40.09 
 
 
437 aa  136  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  37.44 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  35.95 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08020  homoserine dehydrogenase  39.2 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  37.85 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  36.07 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>