More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0971 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  652    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  68.6 
 
 		 328 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  63.27 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  61.28 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  58.95 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  50.46 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  48.48 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  42.81 
 
 		 337 aa  267  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  41.79 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 		 337 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  41.62 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  47.06 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  47 
 
 		 319 aa  248  9e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  46.71 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  46.39 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  45.65 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  43.53 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  40.71 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  42.47 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  37.95 
 
 		 426 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  37.95 
 
 		 426 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  41.3 
 
 		 436 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 426 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  39.4 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  45.14 
 
 		 429 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 359 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  38.55 
 
 		 336 aa  195  7e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  39.08 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 		 439 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  39.35 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  39.26 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  36.61 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  38.69 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 431 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  41.41 
 
 		 431 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  38.96 
 
 		 439 aa  185  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  41.79 
 
 		 448 aa  185  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 		 439 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 440 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 431 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  36.83 
 
 		 441 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.73 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  37 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  41.22 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  43.16 
 
 		 431 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  36.17 
 
 		 432 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 		 428 aa  183  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 441 aa  182  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1231  homoserine dehydrogenase  37.72 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000217271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.11 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  41.92 
 
 		 440 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  41.62 
 
 		 440 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  35.74 
 
 		 441 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  35.29 
 
 		 427 aa  179  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  40.65 
 
 		 445 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  42.91 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4731  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 444 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.911552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  44.98 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  44.98 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 438 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  35.87 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3725  homoserine dehydrogenase  39.23 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  34.55 
 
 		 436 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  38.81 
 
 		 437 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  35.52 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  34.56 
 
 		 436 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  37.69 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  39.3 
 
 		 430 aa  175  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  39.71 
 
 		 439 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  44.84 
 
 		 438 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  35.37 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0630  homoserine dehydrogenase  38.76 
 
 		 431 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166323  hitchhiker  0.00270815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  36.65 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  34.83 
 
 		 436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  36.92 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  35.37 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 439 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  37.81 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  39.83 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  45.29 
 
 		 432 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 		 428 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  37 
 
 		 414 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 		 431 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>