More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1209 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
340 aa  674    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  75.68 
 
 
337 aa  521  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  75.98 
 
 
337 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  74.77 
 
 
337 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  70.66 
 
 
337 aa  477  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  50.3 
 
 
331 aa  331  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  49.09 
 
 
331 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  48.88 
 
 
335 aa  293  4e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  42.04 
 
 
336 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 
328 aa  263  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 
328 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  40.18 
 
 
328 aa  260  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  39.71 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  40 
 
 
328 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 
353 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  39.36 
 
 
355 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 
353 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  37.01 
 
 
317 aa  220  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 
315 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 
319 aa  212  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  37.57 
 
 
347 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 
349 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  37.28 
 
 
347 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  39.23 
 
 
431 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  35.52 
 
 
319 aa  206  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 
432 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  37.88 
 
 
427 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  38.1 
 
 
429 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 
436 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  38.32 
 
 
436 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  34.4 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 
436 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 
418 aa  192  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  39.51 
 
 
435 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 
431 aa  192  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 
439 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  35.19 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 
341 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 
353 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  36.12 
 
 
439 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 
317 aa  188  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  34.19 
 
 
350 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 
436 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  35.99 
 
 
431 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  36.18 
 
 
438 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  35.63 
 
 
438 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  44.78 
 
 
432 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  32.95 
 
 
350 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 
430 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  38.49 
 
 
431 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  38.49 
 
 
431 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  35.55 
 
 
431 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  37.88 
 
 
431 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  38.05 
 
 
431 aa  185  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  38.14 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  32.95 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  35.1 
 
 
441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  36.66 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1959  Homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000138202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1971  homoserine dehydrogenase  31.99 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0199939  normal  0.403666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09870  homoserine dehydrogenase  34.9 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.469358  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  31.99 
 
 
346 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 
417 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 
417 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  31.99 
 
 
346 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.69 
 
 
431 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 
431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  34.13 
 
 
428 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 
431 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  35.26 
 
 
431 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  37.98 
 
 
400 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 
431 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  32.56 
 
 
347 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  32.75 
 
 
347 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  32.56 
 
 
347 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  39.22 
 
 
431 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 
347 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  36.04 
 
 
438 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 
428 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  34.53 
 
 
314 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  32.28 
 
 
347 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  30.18 
 
 
342 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  34.43 
 
 
436 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  34.13 
 
 
428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 
441 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  35.22 
 
 
432 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  34.23 
 
 
449 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  32.66 
 
 
341 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  33.82 
 
 
428 aa  178  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  33.24 
 
 
447 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  33.53 
 
 
436 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>