More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5063 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 353 aa  705    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  69.88 
 
 		 347 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  69.01 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  62.64 
 
 		 349 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  48.22 
 
 		 359 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  48.04 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  48.47 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  45.35 
 
 		 355 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  45.06 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  43.45 
 
 		 336 aa  262  8e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  37.65 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  40.82 
 
 		 328 aa  222  9e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  40.71 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  39.64 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  40.87 
 
 		 330 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  38.76 
 
 		 337 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 350 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  40.48 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  37.21 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  37.35 
 
 		 328 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  33.62 
 
 		 436 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  33.8 
 
 		 436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  35.19 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 432 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  42.13 
 
 		 436 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  35.28 
 
 		 431 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  41.46 
 
 		 428 aa  182  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  35.21 
 
 		 436 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  34.99 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  36.5 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  40.43 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  34.08 
 
 		 436 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  44.26 
 
 		 431 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  34.91 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  34.69 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  40.77 
 
 		 431 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  43.83 
 
 		 431 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  43.83 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  41.8 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  42.79 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 417 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 431 aa  175  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 417 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 431 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 		 431 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  43.83 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  42 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2574  Homoserine dehydrogenase  33.71 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  43.91 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  46.19 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  35.28 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  44.17 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  35.28 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  40.33 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  42.55 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 		 439 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  40.34 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  41.1 
 
 		 440 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  40.16 
 
 		 439 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  34.6 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  32.55 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  42.98 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  38.24 
 
 		 448 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2012  homoserine dehydrogenase  32.55 
 
 		 342 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148212  normal  0.080267 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  36.78 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  39.37 
 
 		 439 aa  169  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  36.26 
 
 		 353 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  35.07 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0318  Homoserine dehydrogenase  45.15 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.23744 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  36.9 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  37.55 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  43.81 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  38.08 
 
 		 424 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  43.31 
 
 		 441 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  42.48 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26330  homoserine dehydrogenase  38.67 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  41.2 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  36.12 
 
 		 440 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  32.84 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  38.72 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  41.28 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  40.35 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>