More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1716 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 314 aa  630  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  52.23 
 
 		 317 aa  338  5e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  36.12 
 
 		 355 aa  195  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  36.17 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  34.64 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  34.44 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  34.53 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  35.05 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  40.73 
 
 		 353 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  35.15 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  35.15 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  33.93 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  36.8 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  33.14 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  36.54 
 
 		 359 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2626  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000765985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  35.31 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2664  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0949  homoserine dehydrogenase  34.85 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.949052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1842  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2388  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286654  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  33.23 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2433  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 347 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.473371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2608  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 347 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2580  homoserine dehydrogenase  32.84 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4165  homoserine dehydrogenase  31.17 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.250616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2743  homoserine dehydrogenase  32.54 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.132697  hitchhiker  0.00000150088 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2625  homoserine dehydrogenase  32.64 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000469823 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2354  homoserine dehydrogenase  32.94 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2526  homoserine dehydrogenase  32.05 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0271  homoserine dehydrogenase  37.26 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.508007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  32.01 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  35.03 
 
 		 441 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0379  homoserine dehydrogenase  34.7 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.768095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  34.27 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  32.7 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 440 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  38.13 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  33.75 
 
 		 431 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  33.75 
 
 		 431 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  33.86 
 
 		 441 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  33.43 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 431 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 431 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  34.16 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 431 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0731  homoserine dehydrogenase  33.84 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  33.02 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  33.75 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  33.12 
 
 		 431 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 424 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 431 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  31.38 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  34.58 
 
 		 433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  32.81 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  31.09 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  33.12 
 
 		 440 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  33.02 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  33.96 
 
 		 439 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  37.95 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  32.91 
 
 		 429 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  34.05 
 
 		 434 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0783  homoserine dehydrogenase  34.35 
 
 		 429 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00270854  unclonable  0.0000000575852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  32.18 
 
 		 431 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  32.19 
 
 		 431 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  31.58 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  33.64 
 
 		 445 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5333  homoserine dehydrogenase  33.13 
 
 		 433 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.767379 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11421  homoserine dehydrogenase  31.99 
 
 		 433 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.209412  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  30.6 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1376  homoserine dehydrogenase  37.28 
 
 		 415 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  32.82 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  32.4 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  38.3 
 
 		 431 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0284  homoserine dehydrogenase  36.17 
 
 		 441 aa  139  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  32.59 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  32.52 
 
 		 436 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  37.61 
 
 		 436 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  31.51 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  39.2 
 
 		 427 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4841  homoserine dehydrogenase  35.05 
 
 		 429 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00593981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  33.54 
 
 		 720 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  32.71 
 
 		 437 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  31.86 
 
 		 430 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  39.73 
 
 		 427 aa  137  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  33.54 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  30.79 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  32.91 
 
 		 426 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  31.25 
 
 		 438 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  33.96 
 
 		 430 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  33.44 
 
 		 739 aa  136  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  29.48 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  32.4 
 
 		 432 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  31.01 
 
 		 432 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>