More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0284 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0284  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 441 aa  889    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0860  homoserine dehydrogenase  49.55 
 
 		 438 aa  418  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.017488  hitchhiker  0.0000000731878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  36.09 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 		 434 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  35.94 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  36.47 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  35.48 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  35.71 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 		 434 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  35.98 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  34.23 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  36.24 
 
 		 437 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  36.24 
 
 		 437 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 		 435 aa  243  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  36.86 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  36.97 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39490  homoserine dehydrogenase  35.97 
 
 		 439 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126248  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2010  homoserine dehydrogenase  37.98 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000414031  normal  0.35034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  35.02 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  34.1 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  36.01 
 
 		 431 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  34.24 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  35.41 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0843  homoserine dehydrogenase  36.22 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  34.33 
 
 		 436 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 		 449 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  35.21 
 
 		 440 aa  232  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  33.58 
 
 		 424 aa  232  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1439  homoserine dehydrogenase  35.56 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0389041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  34.49 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  34.49 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  34.49 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  34.83 
 
 		 447 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  35.14 
 
 		 444 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  34.99 
 
 		 442 aa  229  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1393  Homoserine dehydrogenase  37.87 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  35.73 
 
 		 437 aa  229  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  34.99 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  33.83 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  34.24 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3394  homoserine dehydrogenase  37.2 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  34.24 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  33.83 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  34.03 
 
 		 430 aa  227  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  34.68 
 
 		 430 aa  227  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  31.59 
 
 		 436 aa  227  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  34.57 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  34.33 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  32.67 
 
 		 437 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  32.71 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  34.24 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  34.49 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3010  homoserine dehydrogenase  32.65 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  31.36 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  33.8 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  33.42 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  32.95 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  33.66 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1281  Homoserine dehydrogenase  33.57 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  33.79 
 
 		 432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  32.55 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  33.5 
 
 		 427 aa  222  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0597  homoserine dehydrogenase  35.82 
 
 		 436 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2386  homoserine dehydrogenase  35.5 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  34.07 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  32.18 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  34.09 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  38.97 
 
 		 414 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  34.09 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  34.03 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  34.09 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  34.09 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  33.59 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  34.56 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  34.09 
 
 		 431 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  32.33 
 
 		 448 aa  219  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  31.62 
 
 		 431 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  31.62 
 
 		 431 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  35.64 
 
 		 448 aa  219  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  34.84 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  33.75 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  31.6 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  34.67 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  34.62 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1263  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.692056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1202  homoserine dehydrogenase  33.76 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0498363 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  34.5 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  31.92 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  31.62 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>