More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0271 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0271  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 303 aa  599  1e-170  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.508007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1842  homoserine dehydrogenase  78.07 
 
 		 303 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0949  homoserine dehydrogenase  63.58 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.949052 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0379  homoserine dehydrogenase  62.5 
 
 		 308 aa  364  1e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.768095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1716  Homoserine dehydrogenase  37.26 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2003  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 317 aa  158  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  35.88 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  33.93 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  34.38 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  35.74 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  35.4 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  34.26 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0731  homoserine dehydrogenase  38.06 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  32.19 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  32.62 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  33.23 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  33.03 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  32.11 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  32.42 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  32.32 
 
 		 337 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  32.12 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  29.34 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  31.4 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 353 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  30.65 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0698  homoserine dehydrogenase  31.85 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  0.0139145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  31.85 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  28.92 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  28.71 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  30.67 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  29.47 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4040  Homoserine dehydrogenase  33.46 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  34.17 
 
 		 439 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  31.25 
 
 		 436 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  29.94 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.24 
 
 		 431 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 431 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 431 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  34.35 
 
 		 720 aa  106  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  35.22 
 
 		 739 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  35.81 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1559  homoserine dehydrogenase  34.9 
 
 		 353 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4844  homoserine dehydrogenase  30.77 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0895528 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 431 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 431 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  34.78 
 
 		 440 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 		 431 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  35.81 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  35.81 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  33.62 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  33.19 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  30.9 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  33.2 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4289  homoserine dehydrogenase  30.23 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0299295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  34.87 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  33.76 
 
 		 426 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  33.76 
 
 		 426 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  33.19 
 
 		 436 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  36.68 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6797  homoserine dehydrogenase  30.9 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  35.09 
 
 		 431 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  32.03 
 
 		 418 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  35.62 
 
 		 432 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  33.04 
 
 		 431 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 431 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  34.78 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  29.08 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  34.78 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3931  homoserine dehydrogenase  33.46 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  28.79 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  33.19 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  33.05 
 
 		 438 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  34.93 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1386  Homoserine dehydrogenase  43.36 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000335812  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26813  predicted protein  32.35 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  33.62 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  31.94 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  30.96 
 
 		 428 aa  99.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  28.71 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4072  Homoserine dehydrogenase  32.68 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  32.35 
 
 		 408 aa  99.4  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  33.48 
 
 		 437 aa  99  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  33.62 
 
 		 436 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  32.49 
 
 		 431 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0280  Homoserine dehydrogenase  34.98 
 
 		 427 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  28.79 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  33.77 
 
 		 436 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  30.45 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1904  homoserine dehydrogenase  34.34 
 
 		 420 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 441 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  33.99 
 
 		 437 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  34.82 
 
 		 441 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  28.62 
 
 		 431 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1361  Homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.294507  normal  0.0450512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>