More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14810 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14810  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 425 aa  830    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.342175  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  38.98 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  37.99 
 
 		 431 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 417 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 417 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  37.71 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  37.71 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  39.29 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  38.4 
 
 		 436 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  37.67 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 		 431 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 431 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  40.35 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  37.4 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  35.85 
 
 		 431 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 		 431 aa  226  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  38.63 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.21 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  39.74 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  41.59 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  40.41 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  40.41 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  39.45 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  44.14 
 
 		 435 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  40.25 
 
 		 431 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  39.75 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1756  homoserine dehydrogenase  41.07 
 
 		 439 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230309  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  40.81 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  37.85 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 436 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  41.49 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  36.53 
 
 		 441 aa  216  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  39.57 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  42.63 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 		 434 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  36.73 
 
 		 426 aa  213  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  38.23 
 
 		 438 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  34.23 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1062  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  35.22 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  42 
 
 		 441 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  39.78 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  38.82 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  36.52 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  38.94 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  36.46 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  37.73 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  41.61 
 
 		 440 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  34.77 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  37.15 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  37.06 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  38.51 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  36.22 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4262  homoserine dehydrogenase  39.17 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  0.212459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  37.74 
 
 		 437 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  38.56 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3603  homoserine dehydrogenase  37.81 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  41.43 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  38.51 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  36.96 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  36.96 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  38.51 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  40 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  35.8 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  35.68 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  34.89 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  36.2 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  35.15 
 
 		 441 aa  203  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  38.2 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  38.2 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  32.87 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  36.99 
 
 		 428 aa  203  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  40.4 
 
 		 438 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  43.48 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  38.24 
 
 		 430 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  35.81 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  41.24 
 
 		 455 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  36.86 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  36.52 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  38.44 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>