More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1811 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 594 aa  1161    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  66.76 
 
 		 605 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  66.49 
 
 		 679 aa  495  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  66.22 
 
 		 704 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  64.63 
 
 		 644 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  62.66 
 
 		 751 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  62.95 
 
 		 674 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  58.55 
 
 		 721 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  64.63 
 
 		 662 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  63.8 
 
 		 747 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  64.64 
 
 		 645 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  62.86 
 
 		 658 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  62.63 
 
 		 638 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  55.86 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  62.37 
 
 		 613 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  62.18 
 
 		 696 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  60.71 
 
 		 711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  62.94 
 
 		 717 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  60.8 
 
 		 729 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  61.82 
 
 		 670 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  62.15 
 
 		 698 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  63.56 
 
 		 668 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 713 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  61.8 
 
 		 684 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  61.83 
 
 		 685 aa  464  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  61.74 
 
 		 712 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  61.32 
 
 		 709 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  61.32 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  61.21 
 
 		 663 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  59.95 
 
 		 642 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  61.21 
 
 		 663 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  61.21 
 
 		 663 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  59.2 
 
 		 420 aa  458  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 602 aa  457  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  54.99 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  59.48 
 
 		 689 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  63.3 
 
 		 578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  59.28 
 
 		 656 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  59.78 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  57.28 
 
 		 597 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 688 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  59.51 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  46.49 
 
 		 653 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  58.72 
 
 		 662 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 675 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0531  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 701 aa  449  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000460455 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  52.95 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  57.25 
 
 		 690 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  58.33 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  60.75 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  59.19 
 
 		 418 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  59.19 
 
 		 418 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  58.97 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  55.45 
 
 		 653 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  49.31 
 
 		 579 aa  438  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  58.22 
 
 		 415 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  55.36 
 
 		 573 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  57.3 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  57.29 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  57.97 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  58.04 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 436 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1083  transcription termination factor Rho  59.78 
 
 		 474 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000288858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 602 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.29 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  57.56 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1215  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 424 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000539864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  57.56 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  57.56 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  57.56 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3070  transcription termination factor Rho  58.24 
 
 		 615 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581675  hitchhiker  0.00476927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1778  transcription termination factor Rho  55.65 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1189  transcription termination factor  57.61 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000172016  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  58.08 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  56.99 
 
 		 548 aa  423  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  55.95 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  57.3 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  58.86 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  57.42 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1864  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.462467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  57.77 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  57.26 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  55.82 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  57.56 
 
 		 419 aa  425  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  56.53 
 
 		 750 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0126  transcription termination factor Rho  57.57 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4662  transcription termination factor Rho  56.1 
 
 		 604 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2471  transcription termination factor Rho  55.3 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.94389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2181  transcription termination factor Rho  55.3 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  56.79 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  57.26 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  57.03 
 
 		 420 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>