More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2181 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2471  transcription termination factor Rho  99.79 
 
 		 489 aa  976    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.94389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2181  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 486 aa  978    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  66.76 
 
 		 653 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  55.56 
 
 		 508 aa  510  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  63.8 
 
 		 690 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0410  transcription termination factor Rho  61.58 
 
 		 650 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  63.61 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  62.6 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  62.6 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  62.6 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  62.81 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  62.88 
 
 		 423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  62.33 
 
 		 423 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  62.6 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  62.6 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  62.36 
 
 		 425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 424 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  62.33 
 
 		 423 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  61.22 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  62.47 
 
 		 642 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  62.33 
 
 		 423 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  62.33 
 
 		 423 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  61.85 
 
 		 450 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  63.26 
 
 		 436 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  62.88 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  51.35 
 
 		 492 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  64.84 
 
 		 429 aa  458  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  58.64 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  61.05 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  59.46 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  61.71 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  59.46 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1063  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000384674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  61.71 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  59.51 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  61.58 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  61.05 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  61 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  59.36 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  60.5 
 
 		 429 aa  443  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  57.03 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  59.45 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  60.71 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  59.45 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  59.5 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  59.73 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  60.27 
 
 		 421 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  60.61 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  59.94 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  58.79 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  60.61 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  58.52 
 
 		 548 aa  439  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  59.5 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  59.12 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 		 415 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0126  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1864  transcription termination factor Rho  59.46 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.462467  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  58.97 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  50 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  60.88 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  59.02 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  59.94 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  58.36 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  58.36 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  57.65 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  60.44 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  57.65 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 644 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 415 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 421 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  55.81 
 
 		 415 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  57.88 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  59.4 
 
 		 421 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  58.36 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 750 aa  435  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  60.11 
 
 		 573 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0173  transcription termination factor Rho  60.54 
 
 		 399 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.770214  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  58.13 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 602 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  57.6 
 
 		 421 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  55.28 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  56.72 
 
 		 679 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>