More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2195 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  95.21 
 
 
438 aa  858    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  100 
 
 
438 aa  893    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  100 
 
 
438 aa  893    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  68.4 
 
 
423 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  68.4 
 
 
423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  68.4 
 
 
423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  68.4 
 
 
423 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  68.4 
 
 
423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  68.15 
 
 
423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  68.15 
 
 
423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  67.9 
 
 
423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  67.9 
 
 
423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  68.15 
 
 
423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  67.9 
 
 
423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  66.59 
 
 
424 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  67.9 
 
 
424 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  62.16 
 
 
434 aa  528  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  62.16 
 
 
436 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  61.73 
 
 
450 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  62.47 
 
 
425 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  60.59 
 
 
418 aa  501  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  57.8 
 
 
416 aa  498  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  60.99 
 
 
414 aa  498  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  59.46 
 
 
445 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  58.55 
 
 
642 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  58.72 
 
 
444 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 
420 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  63.36 
 
 
653 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 
690 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 
437 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  58.02 
 
 
415 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  57.78 
 
 
415 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  56.97 
 
 
415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  55.96 
 
 
415 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 
415 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  58.87 
 
 
498 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  53.5 
 
 
449 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 
415 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  56.05 
 
 
415 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  59.42 
 
 
429 aa  461  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 
415 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1189  transcription termination factor  55.45 
 
 
424 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000172016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 
415 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  55.47 
 
 
415 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  61.48 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1215  transcription termination factor Rho  55.21 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000539864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 
429 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  57.22 
 
 
414 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  62.37 
 
 
508 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  57.7 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1864  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 
496 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.462467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  53.77 
 
 
503 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  53.99 
 
 
457 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  54.39 
 
 
415 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 
429 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  57.76 
 
 
429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  56.59 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  53.19 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  54.7 
 
 
421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  56.97 
 
 
429 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  54.24 
 
 
418 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  52.8 
 
 
431 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  54.63 
 
 
497 aa  451  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2471  transcription termination factor Rho  59.46 
 
 
489 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.94389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2181  transcription termination factor Rho  59.46 
 
 
486 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  52.67 
 
 
548 aa  446  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  53.51 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  53.64 
 
 
421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  53.4 
 
 
421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  55.74 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  52.42 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  60.06 
 
 
417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  53.64 
 
 
421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  52.78 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  52.78 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0176  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 
419 aa  441  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0638  transcription termination factor Rho  52.88 
 
 
420 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  52.91 
 
 
421 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  53.4 
 
 
421 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 
419 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  52.17 
 
 
419 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  53.27 
 
 
421 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  52.17 
 
 
419 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  52.12 
 
 
429 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  55.39 
 
 
429 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  52.05 
 
 
419 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1308  transcription termination factor Rho  52.81 
 
 
420 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>