More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1864 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1864  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 496 aa  1016    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.462467  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  55.21 
 
 		 548 aa  535  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 414 aa  512  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  57.8 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  60.74 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  60.49 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  60.4 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  59.52 
 
 		 419 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  60.25 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  60.49 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  59.3 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  59.22 
 
 		 419 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  59.07 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  59.53 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  60.49 
 
 		 415 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  61.27 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  59.61 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  59.9 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  58.57 
 
 		 420 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  60.77 
 
 		 415 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  59 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  60.64 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  58.51 
 
 		 429 aa  498  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  61.17 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1365  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0123945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  61.17 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  59.71 
 
 		 419 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  58.03 
 
 		 450 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  56.09 
 
 		 449 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  56.9 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  57.37 
 
 		 436 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  53.56 
 
 		 497 aa  498  1e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  58.77 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  57.28 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  56.9 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  58.03 
 
 		 450 aa  497  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  60.64 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  59.24 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  60.39 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  57.68 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 447 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  58.84 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  61.12 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  61.12 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  58.84 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  60.64 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  53.9 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  59.29 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  58.1 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  60.39 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  58.29 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  59 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  58.88 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  61.33 
 
 		 573 aa  492  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  60.39 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  56.43 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  60.39 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2118  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 421 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  58.02 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  57.98 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  57.71 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>