More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2402 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  100 
 
 
429 aa  862    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  71.16 
 
 
425 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  72.32 
 
 
436 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  69.38 
 
 
450 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  63.06 
 
 
492 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  64.93 
 
 
434 aa  559  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  64.93 
 
 
424 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  68.43 
 
 
458 aa  548  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  62.68 
 
 
418 aa  545  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  64.45 
 
 
424 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  63.21 
 
 
423 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  66.08 
 
 
653 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 
423 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 
423 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 
423 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 
423 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 
423 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 
423 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 
423 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 
423 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 
423 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  61.9 
 
 
415 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 
423 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  62.95 
 
 
420 aa  532  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  67.28 
 
 
690 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 
437 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  60.28 
 
 
415 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  59.86 
 
 
414 aa  524  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 
415 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  60.52 
 
 
415 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  60.81 
 
 
416 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  61.28 
 
 
445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  59.34 
 
 
415 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  58.92 
 
 
418 aa  513  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  58.92 
 
 
418 aa  513  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 
415 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  59.34 
 
 
415 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  59.05 
 
 
415 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 
444 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  62.2 
 
 
642 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  58.63 
 
 
415 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  58.69 
 
 
421 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  58.87 
 
 
415 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  58.69 
 
 
419 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  58.69 
 
 
419 aa  505  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  58.69 
 
 
418 aa  505  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  59.05 
 
 
415 aa  504  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 
419 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  59.29 
 
 
429 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  57.78 
 
 
416 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 
419 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2310  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 
432 aa  502  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  normal  0.229849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 
419 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 
421 aa  498  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 
419 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  58.39 
 
 
418 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 
420 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 
419 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  56.57 
 
 
420 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  56.57 
 
 
420 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 
419 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1990  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 
435 aa  500  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 
419 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  57.28 
 
 
419 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  59.05 
 
 
429 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  59.35 
 
 
418 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  57.98 
 
 
418 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 
424 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  57.28 
 
 
419 aa  498  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2293  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 
435 aa  500  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 
418 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 
419 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 
421 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  58.81 
 
 
429 aa  499  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 
419 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 
419 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  57.11 
 
 
435 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  57.89 
 
 
429 aa  496  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  57.04 
 
 
419 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 
418 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  57.89 
 
 
429 aa  494  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  57.98 
 
 
418 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  57.92 
 
 
419 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  56.57 
 
 
418 aa  497  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  57.04 
 
 
433 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  57.98 
 
 
418 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 
421 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 
419 aa  494  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  57.62 
 
 
429 aa  497  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  57.55 
 
 
449 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  60.4 
 
 
548 aa  492  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  57.75 
 
 
421 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  57.28 
 
 
421 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 
503 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 
437 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 
421 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  58.53 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  57.45 
 
 
419 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3189  transcription termination factor Rho  57.98 
 
 
422 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0152106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>