More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3627 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  82.62 
 
 		 445 aa  709    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 420 aa  852    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  83.1 
 
 		 444 aa  708    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  78.33 
 
 		 416 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  71.6 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  78.14 
 
 		 417 aa  592  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1189  transcription termination factor  63.74 
 
 		 424 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000172016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1215  transcription termination factor Rho  63.98 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000539864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  63.57 
 
 		 424 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  62.53 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  60.72 
 
 		 450 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 436 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  62.62 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  58.91 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  58.91 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  60.1 
 
 		 425 aa  518  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  66.49 
 
 		 653 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  58.81 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  59.52 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  58.43 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  61.48 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  61 
 
 		 423 aa  511  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  61.48 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  61.48 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  61.48 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  61 
 
 		 423 aa  511  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  61 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  61.48 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  61 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  58.43 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  57.72 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  62.95 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  61.24 
 
 		 423 aa  508  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  58.91 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  57.01 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  57.24 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  58.1 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 		 457 aa  502  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  58.81 
 
 		 414 aa  503  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 416 aa  501  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  64.11 
 
 		 605 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  57.62 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  63.01 
 
 		 679 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  56.57 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  55.82 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  64.05 
 
 		 690 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  57.82 
 
 		 449 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  56.34 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  63.84 
 
 		 676 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  56.1 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  55.92 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  55.92 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  57.58 
 
 		 503 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  66.12 
 
 		 508 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  57.11 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  55.9 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  55.42 
 
 		 420 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  55.42 
 
 		 420 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  61.92 
 
 		 644 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  54.95 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  55.42 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  55.74 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  54.95 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  56.64 
 
 		 421 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  56.57 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  62.19 
 
 		 704 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  55.92 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  55.9 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  56.12 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  55.95 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  51.71 
 
 		 492 aa  478  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1990  transcription termination factor Rho  55.16 
 
 		 435 aa  478  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  53.88 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  56.38 
 
 		 458 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  57.11 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  55.79 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  53.88 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  53.88 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  53.88 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2293  transcription termination factor Rho  55.16 
 
 		 435 aa  478  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  54.57 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  54.46 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  56.14 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  53.88 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  54.69 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  54.69 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  55.16 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  55.08 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  54.85 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  54.69 
 
 		 419 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  53.77 
 
 		 420 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>