More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2875 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 414 aa  847    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  62.29 
 
 		 434 aa  548  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  64.56 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  64.81 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  63.35 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  63.35 
 
 		 423 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  63.35 
 
 		 423 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  63.35 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  63.35 
 
 		 423 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  63.83 
 
 		 423 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 423 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 423 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  61.2 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  61.99 
 
 		 436 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  60.83 
 
 		 450 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  59.95 
 
 		 458 aa  507  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  59.61 
 
 		 445 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  59.37 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  64.27 
 
 		 653 aa  502  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  58.19 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  60.99 
 
 		 438 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  57.46 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  60.99 
 
 		 438 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  57.04 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  61.23 
 
 		 438 aa  495  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  56.66 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  56.42 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  56.42 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0281  transcription termination factor Rho  56.97 
 
 		 422 aa  490  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.697975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  55.9 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  55.31 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  57.39 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  55.45 
 
 		 415 aa  484  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 		 690 aa  484  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  55.9 
 
 		 437 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  56.12 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1364  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000237844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  56.04 
 
 		 414 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 642 aa  480  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1322  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  54.83 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  54.09 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1215  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000539864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  53.98 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1189  transcription termination factor  57.45 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000172016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  61.6 
 
 		 492 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  54.57 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  53.24 
 
 		 418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  52.42 
 
 		 548 aa  468  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  56.97 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  55.48 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  54.35 
 
 		 421 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  55.48 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  62.6 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  55.07 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  53.24 
 
 		 418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  55.95 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  53.86 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  55.48 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  52.16 
 
 		 419 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  55.34 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  52.77 
 
 		 503 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  53.51 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  52.64 
 
 		 419 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  54.52 
 
 		 418 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  52.66 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  54.59 
 
 		 419 aa  467  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  54.52 
 
 		 418 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  53.96 
 
 		 418 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  55.24 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  53.62 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  53.27 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  52.88 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  53.51 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  53.27 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  52.76 
 
 		 418 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  55.24 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  52.77 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 573 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  52.88 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0322242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  52.88 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>