More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1252 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 457 aa  923    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  62.69 
 
 		 418 aa  521  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  61.11 
 
 		 642 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  58.81 
 
 		 415 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  58.56 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  56.94 
 
 		 437 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 		 420 aa  502  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  59.55 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  57.57 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  57.32 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  64.36 
 
 		 653 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  59 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  57.66 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  64.92 
 
 		 690 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  57.82 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  57.32 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  58.92 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  58.39 
 
 		 424 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  59.12 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  59.12 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 416 aa  491  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  59.12 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  58.71 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  56.97 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  58.64 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  59.12 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  58.88 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  58.88 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  56.68 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  57.5 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  58.88 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  59.12 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  58.64 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  56.82 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  58.64 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  57.39 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  56.34 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  58.31 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  56.75 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  55.56 
 
 		 421 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 		 548 aa  481  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  59.17 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  59.17 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  57.28 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  55.05 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  55.05 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  56.54 
 
 		 418 aa  478  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  56.63 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  56.05 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0281  transcription termination factor Rho  55.72 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.697975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  56.02 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  55.96 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  56.02 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  55.75 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  55.29 
 
 		 419 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  61.52 
 
 		 518 aa  475  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  55.29 
 
 		 419 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4111  transcription termination factor Rho  54.78 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0397  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0512  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.855654  hitchhiker  0.00605573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  55.67 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  55.96 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  52.78 
 
 		 503 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  54.33 
 
 		 508 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  55.8 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  56.02 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  55.96 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 420 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  55.96 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  56.02 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0337  transcription termination factor Rho  55.02 
 
 		 421 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  56.02 
 
 		 419 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0409  transcription termination factor Rho  55.75 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3616  transcription termination factor Rho  55.75 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  64.61 
 
 		 492 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  55.96 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  55.75 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  53.76 
 
 		 449 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  55.72 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3953  transcription termination factor Rho  55.28 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  55.77 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  55.96 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  55.77 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  56.16 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  55.77 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3930  transcription termination factor Rho  55.26 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  55.77 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  55.64 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>