More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2173 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 492 aa  995    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  80.75 
 
 		 458 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  75.33 
 
 		 436 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  61.62 
 
 		 450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  69.73 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  62 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  67.82 
 
 		 424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  67.4 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  68.23 
 
 		 424 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 548 aa  510  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  66.85 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  68.25 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  65.94 
 
 		 423 aa  501  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  64.67 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  65.4 
 
 		 423 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  65.12 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  64.58 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  65.4 
 
 		 423 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  63.74 
 
 		 653 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  64.85 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1083  transcription termination factor Rho  55.79 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000288858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  64.36 
 
 		 690 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  65 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  64.03 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  64.38 
 
 		 437 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  63.49 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  64.17 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  63.49 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  54.26 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  52.24 
 
 		 498 aa  485  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  62.94 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  62.87 
 
 		 642 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  63.74 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  63.74 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  51.71 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 		 418 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  61.6 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  64.61 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  63.91 
 
 		 419 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00570  transcription termination factor Rho  62.81 
 
 		 421 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.576624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  63.64 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  62.88 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  63.91 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  62.88 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  63.16 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  61.43 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  64.25 
 
 		 573 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  63.71 
 
 		 436 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  64.19 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 419 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  60.53 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  62.78 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  58.82 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  62.23 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  62.23 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  60.86 
 
 		 437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  63.22 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0322242 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  51.81 
 
 		 512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  63.91 
 
 		 419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  61.81 
 
 		 418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  63.91 
 
 		 450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5019  transcription termination factor Rho  60.27 
 
 		 473 aa  468  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000339489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  60.59 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  61.73 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  63.16 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  63.22 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  63.99 
 
 		 436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  64.46 
 
 		 419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  63.22 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  63.64 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  63.91 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  60.97 
 
 		 602 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  63.51 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  63.09 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>