More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3329 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  75.85 
 
 		 434 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  91.2 
 
 		 423 aa  766    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  90.95 
 
 		 423 aa  765    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  91.2 
 
 		 423 aa  767    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  91.2 
 
 		 423 aa  767    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  90.95 
 
 		 423 aa  762    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  95.99 
 
 		 424 aa  830    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  90.95 
 
 		 423 aa  765    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  90.71 
 
 		 423 aa  764    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  90.71 
 
 		 423 aa  764    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 424 aa  858    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  92.18 
 
 		 423 aa  773    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  91.2 
 
 		 423 aa  766    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  91.2 
 
 		 423 aa  767    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  69.16 
 
 		 436 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  67.48 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  67.9 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  67.9 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  67.9 
 
 		 438 aa  567  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 418 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  64.81 
 
 		 414 aa  550  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  62.98 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  65.21 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  64.48 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  63.08 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  64.48 
 
 		 415 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  64.48 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  63.13 
 
 		 642 aa  531  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  63.02 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  62.53 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  62.77 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  62.17 
 
 		 414 aa  525  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  67.49 
 
 		 653 aa  524  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  64.22 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  61.35 
 
 		 416 aa  522  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  62.08 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  62.62 
 
 		 420 aa  522  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  60.72 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  61.35 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  68.23 
 
 		 492 aa  512  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  61.45 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  60.14 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  61.87 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  67.41 
 
 		 690 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  61.39 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  60.67 
 
 		 503 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  58.95 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  60.68 
 
 		 431 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  60.71 
 
 		 421 aa  504  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  63.32 
 
 		 458 aa  501  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  59.76 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  59.76 
 
 		 421 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  58.27 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  59.33 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  58.71 
 
 		 437 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  58.95 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  59.95 
 
 		 419 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  59.05 
 
 		 421 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  59.52 
 
 		 421 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  59.42 
 
 		 418 aa  494  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  58.33 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  60.39 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  58.03 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  58.27 
 
 		 450 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  58.39 
 
 		 457 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  58.27 
 
 		 450 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  58.03 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  57.97 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  59.13 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  67.11 
 
 		 508 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  57.79 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  59.23 
 
 		 418 aa  488  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  59.29 
 
 		 422 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  58.94 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  57.97 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  57.55 
 
 		 419 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>