More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0734 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  100 
 
 
437 aa  892    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  95.27 
 
 
437 aa  813    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  95.2 
 
 
417 aa  799    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  95.2 
 
 
417 aa  799    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  69.69 
 
 
415 aa  598  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  69.45 
 
 
415 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  68.5 
 
 
415 aa  596  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  68 
 
 
422 aa  591  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  69.21 
 
 
415 aa  594  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  68.74 
 
 
415 aa  591  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  67.45 
 
 
419 aa  593  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  68.5 
 
 
415 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  67.06 
 
 
415 aa  592  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  68.97 
 
 
415 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  68.5 
 
 
415 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  68.25 
 
 
422 aa  590  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  68.02 
 
 
437 aa  589  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  67.93 
 
 
421 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  68.17 
 
 
421 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  67.46 
 
 
421 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  68.41 
 
 
421 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  68.17 
 
 
421 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  66.21 
 
 
428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  66.03 
 
 
419 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  68.17 
 
 
421 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  67.46 
 
 
421 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5019  transcription termination factor Rho  67.3 
 
 
473 aa  581  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000339489  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  67.93 
 
 
421 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  68.25 
 
 
422 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  67.7 
 
 
436 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  67.7 
 
 
421 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  67.7 
 
 
421 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  67.46 
 
 
418 aa  578  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  67.7 
 
 
418 aa  579  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  64.81 
 
 
484 aa  578  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  67.22 
 
 
421 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  67.93 
 
 
436 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  66.59 
 
 
429 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  66.98 
 
 
421 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  65.33 
 
 
418 aa  578  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  67.7 
 
 
447 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  68.17 
 
 
418 aa  580  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  65.33 
 
 
418 aa  578  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  67.46 
 
 
447 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  67.46 
 
 
506 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  68.25 
 
 
422 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  66.98 
 
 
421 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1282  transcription termination factor Rho  65.18 
 
 
430 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0183251  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  66.35 
 
 
418 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2248  transcription termination factor Rho  64 
 
 
420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  66.04 
 
 
419 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  66.35 
 
 
418 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  64 
 
 
420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  67.22 
 
 
418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  64 
 
 
420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  64 
 
 
420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  65.14 
 
 
436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  64.94 
 
 
419 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  65.4 
 
 
419 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  63.53 
 
 
420 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  64.15 
 
 
420 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1365  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0123945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  65.17 
 
 
419 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  65.17 
 
 
419 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  67.46 
 
 
421 aa  568  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  64 
 
 
420 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  66.98 
 
 
418 aa  568  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  65.4 
 
 
418 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1031  transcription termination factor Rho  64.24 
 
 
420 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464905  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  63.53 
 
 
420 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  65.4 
 
 
419 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  64.24 
 
 
420 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  64.45 
 
 
419 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  64.93 
 
 
419 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  64.45 
 
 
419 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  63.53 
 
 
422 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  64.55 
 
 
450 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  64.45 
 
 
419 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
419 aa  565  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2118  transcription termination factor Rho  63.53 
 
 
420 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299268  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  65.81 
 
 
424 aa  568  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  64.64 
 
 
421 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  63.47 
 
 
435 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  64.45 
 
 
419 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  64.55 
 
 
450 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  63.53 
 
 
422 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  64.45 
 
 
419 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2135  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 
420 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173843  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4906  transcription termination factor Rho  63.53 
 
 
420 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.957069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  66.35 
 
 
434 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  64.45 
 
 
419 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  64.22 
 
 
419 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>