More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1393 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0281  transcription termination factor Rho  83.61 
 
 		 422 aa  717    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.697975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 423 aa  856    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1322  transcription termination factor Rho  77.38 
 
 		 427 aa  650    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1364  transcription termination factor Rho  77.38 
 
 		 427 aa  650    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000237844  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0034  transcription termination factor Rho  65.47 
 
 		 441 aa  560  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  59.51 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  59.27 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  59.76 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  58.39 
 
 		 437 aa  508  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  58.95 
 
 		 424 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  57.59 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  58.94 
 
 		 418 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  58.82 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  55.9 
 
 		 415 aa  501  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  59.02 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  60.34 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  56.13 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 415 aa  501  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  58.78 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  58.54 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  57.46 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  56.55 
 
 		 444 aa  495  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  56.14 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 		 436 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  58.81 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  58.23 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  58.23 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  55.58 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  57.43 
 
 		 450 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  58.81 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  56.97 
 
 		 457 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  58.71 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  58.23 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  58.81 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  58 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  58 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  57.76 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  57.76 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  55.9 
 
 		 420 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  57.8 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  55.66 
 
 		 416 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  57.46 
 
 		 425 aa  487  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  56.12 
 
 		 450 aa  478  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  56.25 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  55.26 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  56.49 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  56.25 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  56.12 
 
 		 450 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  56.9 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 419 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  55.21 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  56.31 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  56.23 
 
 		 503 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  55.77 
 
 		 419 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  54.5 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  54.81 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  54.5 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  55.48 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  55.56 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  54.81 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  54.81 
 
 		 642 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  55.34 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  55.42 
 
 		 548 aa  472  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0176  transcription termination factor Rho  56.19 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  55.45 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  54.33 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  55.45 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  54.33 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>