More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3376 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 690 aa  1395    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  60.2 
 
 		 653 aa  775    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  64.86 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1063  transcription termination factor Rho  58.07 
 
 		 556 aa  527  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000384674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  66.67 
 
 		 434 aa  523  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  67.13 
 
 		 424 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  67.13 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  66.57 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  66.57 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  66.11 
 
 		 450 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  67.41 
 
 		 424 aa  512  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  65.38 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  65 
 
 		 642 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  66.3 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  66.3 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  66.3 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  66.02 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  66.3 
 
 		 423 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  66.3 
 
 		 423 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  66.3 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  66.02 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2471  transcription termination factor Rho  64.29 
 
 		 489 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.94389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2181  transcription termination factor Rho  63.8 
 
 		 486 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  66.3 
 
 		 423 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  65.47 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  68.96 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  66.03 
 
 		 418 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  66.02 
 
 		 415 aa  505  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  66.67 
 
 		 444 aa  504  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  65.83 
 
 		 445 aa  502  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0410  transcription termination factor Rho  64.46 
 
 		 650 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  66.02 
 
 		 415 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  66.3 
 
 		 436 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  63.59 
 
 		 548 aa  498  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  64.92 
 
 		 457 aa  498  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  64.09 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  63.26 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  64.36 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  59.43 
 
 		 602 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  64.36 
 
 		 492 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  64.05 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  64.09 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  63.54 
 
 		 415 aa  492  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  63.64 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  63.54 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  63.25 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  64.54 
 
 		 518 aa  492  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0173  transcription termination factor Rho  63.76 
 
 		 399 aa  492  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.770214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  63.25 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  63.81 
 
 		 512 aa  486  1e-136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  61.79 
 
 		 419 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  61.79 
 
 		 419 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  60.53 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  60.26 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  62.98 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  63.32 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 750 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  60.26 
 
 		 419 aa  488  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  61.03 
 
 		 419 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  61.03 
 
 		 419 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  56.59 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  62.02 
 
 		 419 aa  485  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  60.26 
 
 		 421 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  63.11 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  62.33 
 
 		 573 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  61.03 
 
 		 419 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  60.51 
 
 		 418 aa  485  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  61.03 
 
 		 419 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  60.66 
 
 		 419 aa  485  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  60.31 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0176  transcription termination factor Rho  63.01 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  61.92 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  64.07 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  59.79 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  61.03 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  64.35 
 
 		 437 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  61.2 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  62.84 
 
 		 419 aa  481  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0188  transcription termination factor Rho  59.49 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  64.07 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  58.93 
 
 		 419 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  55.22 
 
 		 450 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>