More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1063 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1063  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 556 aa  1100    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000384674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  61.46 
 
 		 653 aa  568  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  70.54 
 
 		 690 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  54.04 
 
 		 508 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  65.05 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  61.92 
 
 		 642 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0410  transcription termination factor Rho  61.6 
 
 		 650 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  59.18 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  62.63 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  64.03 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  64.29 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  64.84 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  59.84 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  63.24 
 
 		 423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  63.39 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  62.16 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  62.43 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  62.16 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  60.57 
 
 		 450 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2471  transcription termination factor Rho  62.1 
 
 		 489 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.94389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2181  transcription termination factor Rho  62.1 
 
 		 486 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  60.21 
 
 		 418 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  61.89 
 
 		 423 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  61.02 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  60.32 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  60.87 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  60.87 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  58.84 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  64.4 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  60.6 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  60.6 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  63.59 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  61.96 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  52.76 
 
 		 573 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  61.96 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  60.6 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  60.43 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  60.6 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  60.6 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  60.6 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  58.9 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 750 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  44.88 
 
 		 602 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0173  transcription termination factor Rho  61.25 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.770214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  58.64 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  58.05 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  59.35 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 419 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  58.58 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  60.6 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  60.7 
 
 		 419 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  58.64 
 
 		 421 aa  445  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  60.6 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  60.6 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  59.4 
 
 		 415 aa  445  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  58.97 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0322242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  59.95 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  46.69 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  59.35 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  58.27 
 
 		 429 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 450 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 419 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  59.89 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  59.78 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  58.97 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  58.76 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>