More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0499 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 497 aa  1004    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  66.59 
 
 		 415 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  67.31 
 
 		 415 aa  570  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  64.16 
 
 		 503 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  64.85 
 
 		 449 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  66.42 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  64.73 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  63.2 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  63.68 
 
 		 437 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  63.68 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  63.44 
 
 		 415 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  63.2 
 
 		 415 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  61.43 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  63.81 
 
 		 428 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  63.2 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  64.65 
 
 		 447 aa  544  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  63.2 
 
 		 415 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  63.7 
 
 		 418 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  65.59 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  63.31 
 
 		 421 aa  541  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  62.71 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  65.59 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  62.95 
 
 		 415 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002098  transcription termination factor Rho  62.74 
 
 		 419 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000734863  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 		 421 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0148  transcription termination factor Rho  63.46 
 
 		 419 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00136527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 		 419 aa  535  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 		 419 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  64.36 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  64.36 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  62.02 
 
 		 421 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  61.26 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 		 421 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 421 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  62.26 
 
 		 421 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  63.46 
 
 		 421 aa  535  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  62.5 
 
 		 418 aa  537  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0173  transcription termination factor Rho  64.66 
 
 		 399 aa  537  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.770214  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  60.53 
 
 		 421 aa  537  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4220  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00203599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  62.11 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  63.22 
 
 		 421 aa  534  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  64.04 
 
 		 422 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  63.95 
 
 		 421 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  62.11 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  64.44 
 
 		 421 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  62.98 
 
 		 421 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  62.74 
 
 		 421 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  62.35 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4003  transcription termination factor Rho  61.81 
 
 		 419 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499603  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  62.35 
 
 		 420 aa  532  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  61.1 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0180  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0511  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0322242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  61.1 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  61.1 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  60.34 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  63.73 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  61.14 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 450 aa  529  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  61.3 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  61.1 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  61.1 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  61.78 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4203  transcription termination factor Rho  61.34 
 
 		 450 aa  528  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  61.1 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  60.62 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  63.7 
 
 		 421 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  61.1 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3189  transcription termination factor Rho  61.63 
 
 		 422 aa  531  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.398952  normal  0.0152106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  61.63 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1123  transcription termination factor Rho  60.82 
 
 		 420 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117933  normal  0.145069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 420 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1990  transcription termination factor Rho  60.95 
 
 		 435 aa  528  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2118  transcription termination factor Rho  60.82 
 
 		 420 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3434  transcription termination factor Rho  61.87 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  61.26 
 
 		 414 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  62.65 
 
 		 422 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3930  transcription termination factor Rho  61.87 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  59.22 
 
 		 484 aa  525  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3878  transcription termination factor Rho  61.87 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0397  transcription termination factor Rho  61.87 
 
 		 421 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  61.06 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0409  transcription termination factor Rho  62.11 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3616  transcription termination factor Rho  62.11 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0459  transcription termination factor Rho  61.63 
 
 		 420 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4071  transcription termination factor Rho  61.87 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  61.63 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  62.11 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  61.78 
 
 		 421 aa  527  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3953  transcription termination factor Rho  61.87 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>