More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1356 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1356  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 417 aa  841    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00013646  hitchhiker  0.000000585861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  76.58 
 
 		 420 aa  594  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  76.52 
 
 		 445 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  75.69 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  73.51 
 
 		 416 aa  561  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  70.64 
 
 		 642 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  63.89 
 
 		 653 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  65.75 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1215  transcription termination factor Rho  58.39 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000539864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  64.01 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1189  transcription termination factor  58.16 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000172016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  65.28 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  62.88 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  61.37 
 
 		 415 aa  471  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  61.28 
 
 		 690 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  61.37 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  60.27 
 
 		 415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  61.37 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  60.82 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  62.67 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  64.44 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  63.89 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  64.17 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  63.61 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  63.89 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  63.89 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  63.61 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  63.61 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  63.89 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  61.43 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  63.61 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  63.89 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  61.11 
 
 		 425 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  59.45 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  59.45 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  62.05 
 
 		 457 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  60.16 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0173  transcription termination factor Rho  61.64 
 
 		 399 aa  461  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.770214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  58.06 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2135  transcription termination factor Rho  60.49 
 
 		 420 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173843  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  59.52 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  59.95 
 
 		 437 aa  455  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0281  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.697975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  61.88 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  60.81 
 
 		 508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  59.05 
 
 		 414 aa  451  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  59.19 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  58.33 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1824  transcription termination factor Rho  57.91 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025276  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2363  transcription termination factor Rho  57.91 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016195  normal  0.176581 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  59.84 
 
 		 418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  57.82 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  59.45 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1767  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0157  transcription termination factor Rho  60.27 
 
 		 419 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  59.84 
 
 		 418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1740  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.318458  normal  0.139414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03661  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000324277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4194  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000794569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1444  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440911  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1853  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.110087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4139  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  59.4 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1187  transcription termination factor Rho  58.86 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.481707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4293  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4197  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1365  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0123945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5215  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2118  transcription termination factor Rho  58.82 
 
 		 420 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  56.64 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2375  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  57.97 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  59.24 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5130  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923516  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4143  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0204  transcription termination factor Rho  60.55 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  58.06 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0042  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1855  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  59.35 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2210  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6250  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156064  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4305  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4128  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4246  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  59.31 
 
 		 418 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0949  transcription termination factor Rho  57.91 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.545356 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4146  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  59.08 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1829  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4011  transcription termination factor Rho  60.55 
 
 		 450 aa  448  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0160  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3999  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>