More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1058 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  82.31 
 
 
645 aa  657    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  80.05 
 
 
644 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  85.34 
 
 
751 aa  710    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  81.88 
 
 
674 aa  687    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  55.99 
 
 
704 aa  653    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  79.69 
 
 
711 aa  642    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  80.37 
 
 
605 aa  644    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  100 
 
 
658 aa  1291    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  82.26 
 
 
680 aa  644    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  80.21 
 
 
729 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  80.63 
 
 
679 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  79.08 
 
 
747 aa  634  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  78.12 
 
 
662 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  76.35 
 
 
713 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  76.42 
 
 
676 aa  620  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  76.67 
 
 
717 aa  611  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  76.49 
 
 
709 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  75.97 
 
 
613 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  73.47 
 
 
721 aa  595  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  75.71 
 
 
662 aa  598  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  74.87 
 
 
670 aa  598  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  52.78 
 
 
656 aa  597  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  75.26 
 
 
668 aa  595  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  62.23 
 
 
663 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  62.23 
 
 
663 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  62.23 
 
 
663 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  75.71 
 
 
578 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  73.39 
 
 
688 aa  588  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  73.4 
 
 
691 aa  588  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  73.15 
 
 
602 aa  588  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  73.25 
 
 
675 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  73.06 
 
 
684 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  73.42 
 
 
689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 
597 aa  565  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  68.43 
 
 
653 aa  559  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  68.36 
 
 
393 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  62.01 
 
 
498 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  60.99 
 
 
638 aa  478  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  62.86 
 
 
594 aa  474  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  60.9 
 
 
685 aa  465  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  60.9 
 
 
546 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  59.19 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  58.38 
 
 
642 aa  458  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0407  transcription termination factor Rho  60.95 
 
 
383 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  58.38 
 
 
444 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  46.14 
 
 
653 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 
420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3070  transcription termination factor Rho  42.01 
 
 
615 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581675  hitchhiker  0.00476927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  59.19 
 
 
419 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  57.26 
 
 
416 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  59.19 
 
 
419 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  58.85 
 
 
406 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 
419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 
419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  56.58 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  55.06 
 
 
573 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  58.49 
 
 
422 aa  445  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  57.33 
 
 
421 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  58.13 
 
 
419 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  54.43 
 
 
602 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  59.4 
 
 
415 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  58.36 
 
 
436 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  56.72 
 
 
690 aa  445  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  58.09 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  55.65 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  55.17 
 
 
518 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1005  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 
576 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297296  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  56.07 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  58.06 
 
 
415 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 
750 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  58.06 
 
 
415 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 
418 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 
421 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  57.33 
 
 
421 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  56.72 
 
 
415 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 
418 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 
421 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  57.34 
 
 
437 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 
428 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 
437 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  56.3 
 
 
421 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  54.77 
 
 
436 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  57.53 
 
 
415 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  56.95 
 
 
419 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  55.78 
 
 
421 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  56.3 
 
 
421 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  57.88 
 
 
417 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 
447 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  37.6 
 
 
579 aa  438  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3616  transcription termination factor Rho  57.07 
 
 
421 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  57.03 
 
 
436 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3434  transcription termination factor Rho  56.65 
 
 
421 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  57.07 
 
 
421 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  57.53 
 
 
415 aa  439  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  57.33 
 
 
420 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  57.88 
 
 
417 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>