More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 713 aa  1413    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  52.42 
 
 		 751 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  76.35 
 
 		 658 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  52.78 
 
 		 704 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  73.82 
 
 		 712 aa  615  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  73.15 
 
 		 729 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  61.05 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  73.01 
 
 		 674 aa  609  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  74.01 
 
 		 680 aa  610  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  73.05 
 
 		 679 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  72.91 
 
 		 711 aa  608  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  72.29 
 
 		 644 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  73.05 
 
 		 605 aa  598  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  72.21 
 
 		 696 aa  598  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  71.85 
 
 		 721 aa  598  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  70.37 
 
 		 747 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  69.6 
 
 		 676 aa  580  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  47.49 
 
 		 656 aa  572  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  68.14 
 
 		 698 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  68.59 
 
 		 670 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  67.75 
 
 		 663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  68.64 
 
 		 668 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  60.25 
 
 		 613 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  67.75 
 
 		 663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  67.75 
 
 		 663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  67.92 
 
 		 717 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  68.33 
 
 		 709 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  68.89 
 
 		 578 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  67.09 
 
 		 689 aa  549  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  67.92 
 
 		 662 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  66.17 
 
 		 691 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  63.5 
 
 		 597 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  65 
 
 		 684 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  65.91 
 
 		 688 aa  538  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  65.83 
 
 		 653 aa  535  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  64.66 
 
 		 602 aa  535  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  66.17 
 
 		 675 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  64.01 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  60.61 
 
 		 546 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  45.05 
 
 		 638 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 		 594 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  57 
 
 		 498 aa  465  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  58.82 
 
 		 685 aa  461  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  56.36 
 
 		 642 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  56.36 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  53.51 
 
 		 653 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 		 415 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  57.33 
 
 		 415 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  57.07 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  55.58 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0407  transcription termination factor Rho  58.57 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  54.94 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  54.66 
 
 		 420 aa  445  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  54.94 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  51.29 
 
 		 602 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  54.26 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  56.28 
 
 		 415 aa  445  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  55.3 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3070  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 615 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581675  hitchhiker  0.00476927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3434  transcription termination factor Rho  55.84 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  37.93 
 
 		 750 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3878  transcription termination factor Rho  55.38 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  55.32 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  52.78 
 
 		 573 aa  442  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3930  transcription termination factor Rho  55.38 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4071  transcription termination factor Rho  55.38 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  47.23 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  52.8 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0459  transcription termination factor Rho  55.64 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  55.86 
 
 		 406 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  55.32 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  54.52 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3953  transcription termination factor Rho  55.84 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  55.04 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  54.62 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  54.62 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  54.62 
 
 		 419 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  53.04 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  54.62 
 
 		 419 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  54.36 
 
 		 518 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  54.07 
 
 		 422 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  54.81 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0447  transcription termination factor Rho  55.13 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  56.79 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  55.06 
 
 		 436 aa  439  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  54.62 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  54.62 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  55.13 
 
 		 421 aa  435  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  54.36 
 
 		 419 aa  435  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 422 aa  436  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  55.01 
 
 		 419 aa  436  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4111  transcription termination factor Rho  55.32 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313563 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  50.36 
 
 		 690 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  55.09 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  54.87 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0337  transcription termination factor Rho  54.87 
 
 		 421 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  55.13 
 
 		 420 aa  433  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>