More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0531 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0531  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 701 aa  1431    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000460455 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  68.84 
 
 		 685 aa  619  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  67.6 
 
 		 546 aa  600  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  61.35 
 
 		 638 aa  589  1e-167  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  60.22 
 
 		 679 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  62.01 
 
 		 498 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  55.1 
 
 		 642 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 594 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 656 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  59.06 
 
 		 711 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  59.06 
 
 		 729 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  59.52 
 
 		 605 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  58.38 
 
 		 689 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 676 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  58.92 
 
 		 662 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  58.58 
 
 		 644 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 		 721 aa  441  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  59.04 
 
 		 674 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  54.74 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  58.02 
 
 		 709 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  58.33 
 
 		 663 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  58.33 
 
 		 663 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  52.76 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  58.33 
 
 		 663 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  58.71 
 
 		 684 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 691 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  52.76 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  56.8 
 
 		 751 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 602 aa  435  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  58.63 
 
 		 578 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  56.46 
 
 		 680 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  58.82 
 
 		 704 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  53.77 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  53.77 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  57.88 
 
 		 613 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  53.77 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  59.4 
 
 		 747 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  53.77 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  52.67 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  57.1 
 
 		 658 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  51.88 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 		 698 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  51.96 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  51.95 
 
 		 420 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  58.7 
 
 		 717 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  56.44 
 
 		 696 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  55.82 
 
 		 712 aa  423  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  52.35 
 
 		 416 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  54.78 
 
 		 713 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  49.1 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  53.41 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  58.4 
 
 		 670 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  53.69 
 
 		 653 aa  422  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  43.19 
 
 		 579 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  52.23 
 
 		 434 aa  418  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1344  transcription termination factor Rho  51.72 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000288127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 662 aa  419  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  52.93 
 
 		 424 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  53.45 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  56.01 
 
 		 645 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  57.34 
 
 		 688 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  49.77 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  52.22 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  53.2 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  41.24 
 
 		 602 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  55 
 
 		 573 aa  416  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  50.12 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  48.82 
 
 		 497 aa  415  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1421  transcription termination factor Rho  50.25 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  51.72 
 
 		 419 aa  411  1e-113  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  52.08 
 
 		 415 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  49.53 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  49.53 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  52.57 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  49.77 
 
 		 432 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  55.32 
 
 		 597 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  52.57 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  50.72 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  52.71 
 
 		 415 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0443  transcription termination factor Rho  49.51 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0265285  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  50.72 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  57.34 
 
 		 675 aa  412  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  51.68 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  51.95 
 
 		 419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  54.08 
 
 		 750 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  51.68 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1778  transcription termination factor Rho  53.74 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  55 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  53.76 
 
 		 653 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  51.68 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2181  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  51.68 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  51.95 
 
 		 419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  52.57 
 
 		 415 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>