More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1200 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 689 aa  1375    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  64.93 
 
 		 656 aa  820    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  72.18 
 
 		 751 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  72.09 
 
 		 679 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  72.46 
 
 		 605 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  73.42 
 
 		 658 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  75.13 
 
 		 674 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  72.34 
 
 		 644 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  71.5 
 
 		 711 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  72.04 
 
 		 729 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  71.82 
 
 		 676 aa  568  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  71.17 
 
 		 680 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  71.39 
 
 		 712 aa  560  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  59.75 
 
 		 704 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  70.73 
 
 		 696 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  70.19 
 
 		 747 aa  551  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  68.32 
 
 		 662 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  66.58 
 
 		 713 aa  548  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  69.97 
 
 		 698 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  60.13 
 
 		 688 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  65.9 
 
 		 721 aa  541  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  68.02 
 
 		 613 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  69.17 
 
 		 670 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  68.1 
 
 		 602 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  71.54 
 
 		 578 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  67.92 
 
 		 709 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  66.58 
 
 		 684 aa  538  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  67.37 
 
 		 717 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  66.22 
 
 		 662 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  68.63 
 
 		 668 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  62.33 
 
 		 675 aa  528  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  65.57 
 
 		 597 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  63.09 
 
 		 653 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  62.9 
 
 		 393 aa  485  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  61.74 
 
 		 685 aa  484  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 546 aa  481  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  59.79 
 
 		 638 aa  466  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  59.44 
 
 		 594 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  59.89 
 
 		 498 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0531  transcription termination factor Rho  58.38 
 
 		 701 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000460455 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  49.77 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  58.63 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  58.63 
 
 		 445 aa  445  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  57.26 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  58.52 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  50.69 
 
 		 573 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  59.07 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  55.16 
 
 		 653 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  57.72 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0407  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 383 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  57.53 
 
 		 415 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  58.24 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  58.31 
 
 		 419 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  58.31 
 
 		 419 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  58.24 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 419 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 419 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  58.38 
 
 		 419 aa  435  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  57.22 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0409  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3616  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  57.34 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  56.99 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  57.77 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  54.26 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  57.97 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0126  transcription termination factor Rho  57.95 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 421 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  57.57 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  55.98 
 
 		 642 aa  432  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 422 aa  432  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0459  transcription termination factor Rho  56.6 
 
 		 420 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0332  transcription termination factor Rho  54.73 
 
 		 658 aa  426  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0176  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  57.69 
 
 		 415 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  55.86 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  53.45 
 
 		 406 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 419 aa  429  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  55.95 
 
 		 421 aa  429  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  56.13 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  55.95 
 
 		 421 aa  428  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3953  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4071  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3930  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  56.03 
 
 		 433 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3878  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  55.41 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  56.87 
 
 		 420 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>