More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2301 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  81.73 
 
 		 653 aa  663    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  79.49 
 
 		 709 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 691 aa  1375    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 		 717 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  85.38 
 
 		 662 aa  688    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  69.52 
 
 		 663 aa  828    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  61.44 
 
 		 613 aa  695    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  91.58 
 
 		 602 aa  734    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  69.52 
 
 		 663 aa  828    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  75.03 
 
 		 684 aa  862    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  69.52 
 
 		 663 aa  828    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  55.83 
 
 		 597 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  76.55 
 
 		 670 aa  616  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  54.84 
 
 		 674 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  74.81 
 
 		 688 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  73.9 
 
 		 644 aa  595  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  75.06 
 
 		 675 aa  595  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  74.29 
 
 		 605 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  74.15 
 
 		 676 aa  595  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  73.13 
 
 		 679 aa  588  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  72.73 
 
 		 658 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  61.18 
 
 		 704 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  60.75 
 
 		 751 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  72.22 
 
 		 712 aa  577  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  70.59 
 
 		 696 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  70.94 
 
 		 662 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  70.38 
 
 		 668 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  68.67 
 
 		 680 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  68.65 
 
 		 645 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  70.88 
 
 		 578 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  47.98 
 
 		 656 aa  540  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  65.34 
 
 		 713 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  67.62 
 
 		 721 aa  537  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  65.62 
 
 		 689 aa  531  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  62.37 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  48.33 
 
 		 638 aa  481  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  60.96 
 
 		 685 aa  462  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  61.39 
 
 		 546 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  61.15 
 
 		 594 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  58.92 
 
 		 642 aa  452  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  39.26 
 
 		 653 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  57.33 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  57.33 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  57.33 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  57.33 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  56.43 
 
 		 498 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  58.11 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  55.24 
 
 		 690 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  56.8 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  57.34 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  56.8 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0531  transcription termination factor Rho  58.45 
 
 		 701 aa  432  1e-120  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000460455 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  38.69 
 
 		 579 aa  435  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  57.34 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  54.24 
 
 		 406 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  56.79 
 
 		 437 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  57.07 
 
 		 437 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  55.76 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  55.38 
 
 		 421 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2158  transcription termination factor Rho  55.14 
 
 		 564 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.156319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  56.72 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  57.3 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  55.12 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  55 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 420 aa  429  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  55 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 421 aa  428  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  57.49 
 
 		 415 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 508 aa  428  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  56.33 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  55.41 
 
 		 421 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  55.8 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  54.99 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0056  transcription termination factor Rho  54.86 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.624347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  56.6 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 447 aa  425  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  53.19 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  50.24 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47410  transcription termination factor Rho  57.3 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  54.86 
 
 		 421 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 415 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03719  transcription termination factor Rho  54.59 
 
 		 629 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  55.14 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  54.64 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  55.95 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  54.57 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  55.95 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  50.24 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  55 
 
 		 421 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 420 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  57.26 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4034  transcription termination factor Rho  53.09 
 
 		 419 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  56.99 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>