More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09300 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  77.34 
 
 		 685 aa  695    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 638 aa  1299    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  72.99 
 
 		 546 aa  721    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0531  transcription termination factor Rho  61.35 
 
 		 701 aa  592  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000460455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  64.78 
 
 		 679 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  64.1 
 
 		 644 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  70.11 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 605 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  63.98 
 
 		 704 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  61.44 
 
 		 662 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  60.51 
 
 		 674 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  60.79 
 
 		 751 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  63.66 
 
 		 676 aa  485  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  51.84 
 
 		 747 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  58.84 
 
 		 721 aa  478  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  63.73 
 
 		 670 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  62.86 
 
 		 717 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  60.73 
 
 		 712 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  60.99 
 
 		 658 aa  478  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  59.79 
 
 		 729 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  60.68 
 
 		 711 aa  478  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  63.73 
 
 		 698 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  62.63 
 
 		 594 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  59.33 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  61.17 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  58.02 
 
 		 713 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  59.22 
 
 		 663 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 		 613 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  59.22 
 
 		 663 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  60 
 
 		 696 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  59.22 
 
 		 663 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  59.53 
 
 		 684 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  61.01 
 
 		 709 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  57.66 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  59.79 
 
 		 689 aa  467  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  61.01 
 
 		 662 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  53.12 
 
 		 642 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  59.33 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  61.6 
 
 		 578 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  57.66 
 
 		 415 aa  465  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  57.66 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  59.84 
 
 		 668 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 415 aa  465  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  62.07 
 
 		 688 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  61.56 
 
 		 653 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  59.47 
 
 		 645 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 418 aa  455  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 		 656 aa  458  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 415 aa  459  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0274  transcription termination factor Rho  55.5 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000543073  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  58.04 
 
 		 579 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  57.42 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 675 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  57.66 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  54.28 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  60.33 
 
 		 750 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1553  transcription termination factor Rho  54.01 
 
 		 447 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000288549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  61.28 
 
 		 690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0605  transcription termination factor Rho  52.6 
 
 		 447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000783157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  58.18 
 
 		 597 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  54.63 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1292  transcription termination factor Rho  54.52 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.345721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  54.63 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  54.63 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  59.78 
 
 		 602 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  56.04 
 
 		 419 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  57.55 
 
 		 653 aa  452  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  54.33 
 
 		 445 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  54.63 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  54.63 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1778  transcription termination factor Rho  58.2 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1173  transcription termination factor Rho  54.77 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.114801  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0572  transcription termination factor Rho  54.52 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.124184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  60.59 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  54.88 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00336  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  55.64 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  58.58 
 
 		 573 aa  452  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  54.63 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  55.07 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  55.07 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0471  transcription termination factor Rho  55.01 
 
 		 434 aa  452  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  54.35 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  53.62 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  54.63 
 
 		 423 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  54.63 
 
 		 423 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  54.39 
 
 		 423 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4662  transcription termination factor Rho  57.1 
 
 		 604 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  51.71 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  54.39 
 
 		 423 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  55.18 
 
 		 420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  54.57 
 
 		 444 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  54.05 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  55.34 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  52.53 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  54.05 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>