More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2620 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  53.21 
 
 		 747 aa  664    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  52.23 
 
 		 704 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  80.21 
 
 		 658 aa  649    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  79.43 
 
 		 644 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  78.27 
 
 		 605 aa  636    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  77.08 
 
 		 751 aa  643    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 729 aa  1445    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  86.51 
 
 		 711 aa  825    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  77.69 
 
 		 676 aa  630  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  51.22 
 
 		 717 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  75.78 
 
 		 662 aa  624  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  76.17 
 
 		 645 aa  613  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  75.32 
 
 		 698 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  72.09 
 
 		 721 aa  605  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  59.57 
 
 		 613 aa  602  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  75.58 
 
 		 578 aa  601  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  62.45 
 
 		 656 aa  595  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  75.07 
 
 		 670 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  73.39 
 
 		 668 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 663 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 663 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  65.67 
 
 		 663 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  71.65 
 
 		 602 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  71.17 
 
 		 675 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  71.61 
 
 		 684 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  70.84 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  72.04 
 
 		 689 aa  572  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  67 
 
 		 597 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  67.77 
 
 		 653 aa  557  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  67.83 
 
 		 393 aa  515  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  61.68 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  61.72 
 
 		 546 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  47.7 
 
 		 638 aa  481  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  58.62 
 
 		 653 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  61.97 
 
 		 685 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  60.29 
 
 		 594 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0407  transcription termination factor Rho  62.53 
 
 		 383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  57.63 
 
 		 690 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  57.95 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  58.38 
 
 		 642 aa  465  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  58.92 
 
 		 444 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  59.19 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  48.78 
 
 		 579 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  56.77 
 
 		 602 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  55.58 
 
 		 750 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  57.56 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  58.58 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 419 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  55.12 
 
 		 573 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  56.72 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0531  transcription termination factor Rho  46.5 
 
 		 701 aa  451  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000460455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 419 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  57.56 
 
 		 415 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  54.27 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  59.4 
 
 		 415 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0397  transcription termination factor Rho  56.8 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  58.02 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 418 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  56.18 
 
 		 450 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  55.21 
 
 		 429 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 418 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0459  transcription termination factor Rho  57.07 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  57.84 
 
 		 421 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  56.8 
 
 		 421 aa  445  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3434  transcription termination factor Rho  56.65 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  53.69 
 
 		 518 aa  446  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  56.6 
 
 		 422 aa  445  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3070  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 615 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581675  hitchhiker  0.00476927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3953  transcription termination factor Rho  56.65 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  56.72 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0337  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 421 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  59.62 
 
 		 458 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0447  transcription termination factor Rho  56.8 
 
 		 421 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0409  transcription termination factor Rho  56.53 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3616  transcription termination factor Rho  56.53 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  56.06 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  56.53 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  56.28 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  56.27 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_002950  PG0332  transcription termination factor Rho  56.73 
 
 		 658 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4071  transcription termination factor Rho  56.53 
 
 		 421 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 421 aa  442  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 421 aa  442  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4662  transcription termination factor Rho  53.83 
 
 		 604 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3878  transcription termination factor Rho  56.53 
 
 		 421 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  57.3 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1005  transcription termination factor Rho  55.79 
 
 		 576 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  56.33 
 
 		 506 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3930  transcription termination factor Rho  56.53 
 
 		 421 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>