More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1284 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 645 aa  1278    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  78.64 
 
 		 674 aa  636    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  82.35 
 
 		 751 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  81.77 
 
 		 658 aa  660    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  77.78 
 
 		 680 aa  632  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  64.58 
 
 		 704 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  76.78 
 
 		 679 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  77.31 
 
 		 644 aa  620  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  50.61 
 
 		 713 aa  618  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  76.17 
 
 		 729 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  77.02 
 
 		 696 aa  614  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  52.02 
 
 		 656 aa  606  9.999999999999999e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  74.55 
 
 		 676 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  74.36 
 
 		 712 aa  602  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  75.46 
 
 		 662 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  64.44 
 
 		 747 aa  595  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  53.99 
 
 		 602 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  72.58 
 
 		 613 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  75.52 
 
 		 578 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  72.06 
 
 		 709 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  72.06 
 
 		 670 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  72.16 
 
 		 668 aa  578  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  70.76 
 
 		 662 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  72.32 
 
 		 717 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  70.03 
 
 		 721 aa  571  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  70.83 
 
 		 663 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  70.83 
 
 		 663 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  70.83 
 
 		 663 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  70.16 
 
 		 684 aa  567  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  68.83 
 
 		 691 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  69.45 
 
 		 688 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  65.66 
 
 		 653 aa  548  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  69.55 
 
 		 675 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  65.05 
 
 		 597 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  65.68 
 
 		 393 aa  495  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  60.84 
 
 		 498 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  64.64 
 
 		 594 aa  475  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  60.76 
 
 		 642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  59.33 
 
 		 444 aa  465  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  59.47 
 
 		 638 aa  461  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  59.79 
 
 		 546 aa  459  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  59.07 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  43.99 
 
 		 602 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  58.49 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  42.63 
 
 		 573 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  55.16 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  56.69 
 
 		 653 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 416 aa  445  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  59.29 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0407  transcription termination factor Rho  58.78 
 
 		 383 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  38.47 
 
 		 579 aa  441  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  55.25 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  57.03 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  58.49 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  56.64 
 
 		 690 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  57.07 
 
 		 422 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  56.76 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  59.07 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  56.72 
 
 		 419 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  56.72 
 
 		 419 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  53.23 
 
 		 750 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  55.91 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  55.33 
 
 		 406 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  55.91 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  55.91 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  57.49 
 
 		 418 aa  435  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  56.46 
 
 		 415 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  55.91 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  57.49 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  55.91 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  56.46 
 
 		 415 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  55.91 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  57.49 
 
 		 418 aa  435  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 518 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2158  transcription termination factor Rho  56.18 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.156319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  56.46 
 
 		 415 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  60.11 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  56.42 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  56.79 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  56.64 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  56.6 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  56.99 
 
 		 420 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 421 aa  429  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1005  transcription termination factor Rho  56.23 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  56.13 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03610  hypothetical protein  55.5 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  55.89 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  57.53 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3676  transcription termination factor Rho  55.91 
 
 		 583 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0447  transcription termination factor Rho  56.18 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  56.32 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03719  transcription termination factor Rho  55.65 
 
 		 629 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  56.79 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3070  transcription termination factor Rho  41.31 
 
 		 615 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581675  hitchhiker  0.00476927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4071  transcription termination factor Rho  55.91 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0337  transcription termination factor Rho  55.91 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  56.13 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>