More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4746 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 393 aa  792    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  73.84 
 
 		 679 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  73.57 
 
 		 605 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  72.75 
 
 		 704 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  70.84 
 
 		 644 aa  545  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  72.21 
 
 		 676 aa  544  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  70.03 
 
 		 662 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  70.46 
 
 		 668 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  68.65 
 
 		 670 aa  522  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4150  transcription termination factor Rho  69.21 
 
 		 747 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1255  transcription termination factor Rho  68.19 
 
 		 696 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.864478  normal  0.0460813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  68.53 
 
 		 712 aa  516  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  69.46 
 
 		 698 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  67.83 
 
 		 729 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  67.56 
 
 		 711 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  66.93 
 
 		 751 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  66.58 
 
 		 662 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  67.47 
 
 		 674 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  67.48 
 
 		 717 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1058  transcription termination factor Rho  68.36 
 
 		 658 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  64.01 
 
 		 713 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  62.88 
 
 		 721 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  66.12 
 
 		 613 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  65.6 
 
 		 680 aa  502  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  64.88 
 
 		 691 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  66.67 
 
 		 709 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  65.14 
 
 		 684 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  65.68 
 
 		 645 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  64.52 
 
 		 663 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  64.52 
 
 		 663 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  64.52 
 
 		 663 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  64.77 
 
 		 602 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  66.4 
 
 		 688 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  64.19 
 
 		 597 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  65.85 
 
 		 675 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  61.56 
 
 		 653 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  66.21 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  62.9 
 
 		 689 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  63.51 
 
 		 656 aa  480  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0407  transcription termination factor Rho  61 
 
 		 383 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  59.27 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  61.26 
 
 		 498 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  59.45 
 
 		 638 aa  437  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  58.36 
 
 		 685 aa  433  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  57.45 
 
 		 546 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  58.49 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  58.49 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  60.43 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  58.49 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  57.77 
 
 		 419 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  58.74 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  58.49 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  58.74 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  59.67 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  57.95 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  57.95 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  58.68 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  58.68 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 420 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  58.15 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  57.68 
 
 		 419 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  58.13 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  55.47 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2970  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  57.46 
 
 		 421 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 653 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 421 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  56.52 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  54.96 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  58.01 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  53.94 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 421 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 421 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 421 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  57.73 
 
 		 421 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  57.3 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  58.5 
 
 		 415 aa  418  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  58.26 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  58.59 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  57.46 
 
 		 421 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 421 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  57.69 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  58.29 
 
 		 421 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  59.15 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  53.69 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5019  transcription termination factor Rho  56.83 
 
 		 473 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000339489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  56.91 
 
 		 421 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  58.33 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3453  transcription termination factor Rho  55.08 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  57.42 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0002  transcription termination factor Rho  57.3 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00303251  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2532  transcription termination factor Rho  58.87 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  56.56 
 
 		 548 aa  413  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>