116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0955 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0955  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 372 aa  726    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.5783  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1280  phage shock protein A  47.66 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.782344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2656  PspA/IM30 family  45.49 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  43.03 
 
 		 263 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  46.55 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  41.99 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1258  Phage shock protein A PspA/IM30  41.99 
 
 		 232 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2228  phage shock protein A, PspA  45.02 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.588183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2534  phage shock protein A, PspA  45.73 
 
 		 254 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  44.78 
 
 		 260 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0950  phage shock protein A, PspA  46.78 
 
 		 263 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013662  normal  0.313997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  40.66 
 
 		 279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  41.63 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1859  phage shock protein A, PspA  47.6 
 
 		 269 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0849  phage shock protein A, PspA  40.69 
 
 		 230 aa  170  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  41.38 
 
 		 233 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  38.26 
 
 		 295 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0952  phage shock protein A, PspA  44.64 
 
 		 260 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0811243  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1435  phage shock protein A, PspA  43.15 
 
 		 247 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3085  phage shock protein A, PspA  43.59 
 
 		 272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0155569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  43.65 
 
 		 272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  41.25 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  35.74 
 
 		 247 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1682  phage shock protein A, PspA  34.33 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.149658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2017  PspA/IM30 family  34.33 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  35.88 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  32.45 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  32.01 
 
 		 256 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  32.97 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  32.65 
 
 		 255 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  32 
 
 		 259 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  31.38 
 
 		 254 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  31.8 
 
 		 254 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  32.65 
 
 		 255 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  30.63 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  29.76 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  27.57 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  30.42 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  29.15 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  29.15 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  29.22 
 
 		 281 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  27.76 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  26.96 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  27.94 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  25.46 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  27.76 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  27.57 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  26.38 
 
 		 224 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  30.7 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  25.23 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  31.65 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  27.18 
 
 		 220 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  30.07 
 
 		 223 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3004  phage shock protein A, PspA  30.51 
 
 		 227 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  22.89 
 
 		 225 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  26.58 
 
 		 227 aa  53.5  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  22.07 
 
 		 234 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  26.47 
 
 		 221 aa  52.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  32.48 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  25.76 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  24.89 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  25.54 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  26.8 
 
 		 250 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  25.11 
 
 		 241 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  24.75 
 
 		 224 aa  49.7  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  31.87 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  34.07 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  30.28 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  30.71 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  27.52 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  28.81 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  27.03 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  29.13 
 
 		 227 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  28.06 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  27.8 
 
 		 221 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  27.8 
 
 		 221 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  32.97 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  25.53 
 
 		 221 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0793  hypothetical protein  27.65 
 
 		 222 aa  47  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.596477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 225 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  34.07 
 
 		 221 aa  46.2  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  25.49 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  25.11 
 
 		 220 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  27.33 
 
 		 226 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3175  phage shock protein A, PspA  23.51 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.406635  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 227 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  28.07 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 219 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 227 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  24.49 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  31.87 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  23.28 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  25.11 
 
 		 221 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  25.11 
 
 		 221 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5260  phage shock protein A, PspA  25.69 
 
 		 226 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0073418  normal  0.71393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>